RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 C2CD4BA6NLJ0 364 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 A6NNZ2 444 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 NEMP1O14524 444 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 RAMP2O60895 175 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 ZMPSTE24O75844 475 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 CALB1P05937 261 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 ALPPL2P10696 532 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 ADRB3P13945 408 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 CHRNB2P17787 502 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 GPD1P21695 349 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 UBXN1Q04323 297 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 SGCGQ13326 291 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 HES3Q5TGS1 186 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 GPT2Q8TD30 523 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 SLC17A9Q9BYT1 436 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 MAGEH1Q9H213 219 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 EVA1BQ9NVM1 165 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 NEMP2A6NFY4 417 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 CCDC172P0C7W6 258 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 UNGP13051 313 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 ACVRL1P37023 503 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 CLDN2P57739 230 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 MYL5Q02045 173 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 CAMK2BQ13554 666 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 STX1AQ16623 288 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 SEL1L3Q68CR1 1132 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 SCYL2Q6P3W7 929 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 TSC1Q92574 1164 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 LRIG1Q96JA1 1093 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 TMEM248Q9NWD8 314 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 AK5Q9Y6K8 562 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 IGF2RP11717 2491 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-212ENST00000484841 TRPM6Q9BX84 2022 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 KRIT1O00522 736 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 EPHB6O15197 1021 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 FFAR2O15552 330 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 LRIG2O94898 1065 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 DGKAP23743 735 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 E2F1Q01094 437 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 RAD51Q06609 339 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 COL28A1Q2UY09 1125 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 EFHC2Q5JST6 749 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 Q6ZSR6 202 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 SLFN11Q7Z7L1 901 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 PLPP6Q8IY26 295 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 OR13H1Q8NG92 308 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 RAB7BQ96AH8 199 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 ARHGEF26Q96DR7 871 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 SIK3Q9Y2K2 1263 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 LGALS16A8MUM7 142 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 H3BM21 787 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 FPGTO14772 594 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 TSPAN6O43657 245 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 SIGLEC6O43699 453 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 AP1G1O43747 822 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 GJB6O95452 261 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 POP4O95707 220 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 ACP1P24666 158 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 TMEM259Q4ZIN3 620 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 RAB6CQ53S08 254 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 DNAJC24Q6P3W2 148 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 CCDC185Q8N715 623 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 C3orf20Q8ND61 904 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 OR2AP1Q8NGE2 309 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 NTAN1Q96AB6 310 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 IFT43Q96FT9 208 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 DCBLD2Q96PD2 775 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 RAB6CQ9H0N0 254 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 SCUBE2Q9NQ36 999 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 DNAJC28Q9NX36 388 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 FADS3Q9Y5Q0 445 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-212ENST00000484841 ACTL7AQ9Y615 435 aa20.5■□□□□ 0.87
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