RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 KRT1P04264 644 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 SETSIPP0DME0 302 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 KRT3P12035 628 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 HOXB2P14652 356 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 LSP1P33241 339 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 FLT3P36888 993 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 GABRB2P47870 512 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 CNGA2Q16280 664 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 TFDP3Q5H9I0 405 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 PPM1JQ5JR12 505 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 RAB41Q5JT25 222 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 EOGTQ5NDL2 527 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 KCTD16Q68DU8 428 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 ARHGAP17Q68EM7 881 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 PCGF5Q86SE9 256 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 NETO1Q8TDF5 533 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 PIGKQ92643 395 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 CENPTQ96BT3 561 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 TLCD1Q96CP7 247 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 OTUB2Q96DC9 234 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 MCEEQ96PE7 176 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 CENPHQ9H3R5 247 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 SYNCQ9H7C4 482 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 LRRC4Q9HBW1 653 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 FSCN3Q9NQT6 498 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 ASNSD1Q9NWL6 643 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 HESX1Q9UBX0 185 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 CLEC4EQ9ULY5 219 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 PCNX2A6NKB5 2137 aa6.42□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 SPEGQ15772 3267 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 CEP295Q9C0D2 2601 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 KNL1Q8NG31 2342 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 A0A0A0MRY4 1105 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 M0QYV0 167 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 O00370 1275 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 NDUFAB1O14561 156 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 RASGRF2O14827 1237 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 SLC30A4O14863 429 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 CACNG3O60359 315 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 LRP3O75074 770 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 TCEA3O75764 348 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 RNF8O76064 485 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 ALDH1A2O94788 518 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 RHOBTB1O94844 696 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 ABHD2P08910 425 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 CISD3P0C7P0 127 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 ZNF806P0C7X5 589 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 GABRG2P18507 467 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 PSMA2P25787 234 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 NTSR1P30989 418 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 PCK1P35558 622 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 ADCY8P40145 1251 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 KCNJ1P48048 391 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 DGKGP49619 791 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 BCAT1P54687 386 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 SLC8A3P57103 927 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 TAS2R40P59535 323 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 BST2Q10589 180 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 STPG1Q5TH74 334 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 PMS2CLQ68D20 193 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 PMF1Q6P1K2 205 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 RASSF3Q86WH2 238 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 VSIG1Q86XK7 387 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 CACUL1Q86Y37 369 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 CHPFQ8IZ52 775 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 C1orf54Q8WWF1 131 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 SORCS1Q8WY21 1168 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 TTC25Q96NG3 672 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 SERPINB12Q96P63 405 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 RTKNQ9BST9 563 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 ANAPC5Q9UJX4 755 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.41□□□□□ -1.38
MITF-215ENST00000478490 PCDH15Q96QU1 1955 aa6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms