RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 THAP2Q9H0W7 228 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 CARD9Q9H257 536 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 CWH43Q9H720 699 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 ARHGEF3Q9NR81 526 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 RXFP3Q9NSD7 469 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 ZSCAN32Q9NX65 697 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 SNTG2Q9NY99 539 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.85□□□□□ -1.31
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CCL20-202ENST00000409189 FBXO4Q9UKT5 387 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 CEP83Q9Y592 693 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 TRPV2Q9Y5S1 764 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 SCINQ9Y6U3 715 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 LACTBL1A8MY62 500 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 MED7O43513 233 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D4O60343 1298 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 ERLIN1O75477 346 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 NPTXRO95502 500 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 FTCDO95954 541 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 CALB1P05937 261 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 MAN1A1P33908 653 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 ACVRL1P37023 503 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 PNPLA4P41247 253 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 MYL6P60660 151 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 TNNC1P63316 161 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 MYO1EQ12965 1108 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 BRD3Q15059 726 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 STILQ15468 1287 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 LIN9Q5TKA1 542 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 JADE1Q6IE81 842 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 ACAD10Q6JQN1 1059 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 WDR93Q6P2C0 686 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 MON1BQ7L1V2 547 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 BEST2Q8NFU1 509 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 ACTRT1Q8TDG2 376 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 DNAJB3Q8WWF6 145 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 NUDT11Q96G61 164 aa6.84□□□□□ -1.31
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CCL20-202ENST00000409189 CPB2Q96IY4 423 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
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CCL20-202ENST00000409189 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 IER2Q9BTL4 223 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 JAM3Q9BX67 310 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 DNAI2Q9GZS0 605 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 PIF1Q9H611 641 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 CISHQ9NSE2 258 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 TAS2R14Q9NYV8 317 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 SIX4Q9UIU6 781 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 AMFRQ9UKV5 643 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 RAB21Q9UL25 225 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 V9GYY5 206 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 DOCK6Q96HP0 2047 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 SPTA1P02549 2419 aa6.84□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CCDC66A2RUB6 948 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 TMCO5BA8MYB1 307 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CCDC188H7C350 402 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 AGRPO00253 132 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 KCNK3O14649 394 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 PDPK1O15530 556 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 THAP12O43422 761 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 MGEA5O60502 916 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 RECQL4O94761 1208 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 KNG1P01042 644 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 FSHBP01225 129 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 KRT19P08727 400 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 TDGF1P13385 188 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 KCNE1P15382 129 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CYP3A5P20815 502 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CTNNA2P26232 953 aa6.83□□□□□ -1.32
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