RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394744.6

RAB11FIP4-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RAB11FIP4, Length 1,968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4-201ENST00000394744 POTEHQ6S545 545 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ACVR1CQ8NER5 493 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 VPS39Q96JC1 886 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DOCK4Q8N1I0 1966 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RAMP2O60895 175 aa20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PARNO95453 639 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 STX3Q13277 289 aa20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PCLAFQ15004 111 aa20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MBLAC2Q68D91 279 aa20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 IGSF21Q96ID5 467 aa20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MCOLN1Q9GZU1 580 aa20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.16■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MYL2P10916 166 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KCNA4P22459 653 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CD86P42081 329 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC25A41Q8N5S1 370 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ARHGEF3Q9NR81 526 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HAO1Q9UJM8 370 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 A0A096LPK6 155 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 VAPBO95292 243 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MPOP05164 745 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 T-ENOLP0DO92 83 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 OR1E1P30953 314 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ACVRL1P37023 503 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TUFMP49411 452 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 IRF9Q00978 393 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DSC2Q02487 901 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SEPT6Q14141 434 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GRM3Q14832 879 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KIAA1841Q6NSI8 718 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CLNKQ7Z7G1 428 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 LGI2Q8N0V4 545 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DNMT3LQ9UJW3 386 aa20.15■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ATP5HO75947 161 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GJB5O95377 273 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SEC24AO95486 1093 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CBX6O95503 412 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MMP2P08253 660 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ARNTP27540 789 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SERPINB3P29508 390 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NUMBP49757 651 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SERINC3Q13530 473 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 IKBKEQ14164 716 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PARP15Q460N3 678 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SPDYAQ5MJ70 313 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CCDC91Q7Z6B0 441 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CRLF3Q8IUI8 442 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TEX26Q8N6G2 289 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NSMCE1Q8WV22 266 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SKA1Q96BD8 255 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 F5H5T6 163 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MGRN1O60291 552 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 C2P06681 752 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KITP10721 976 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GABRB3P28472 473 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC6A4P31645 630 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ETFBP38117 255 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MAPKAPK2P49137 400 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 IL10RBQ08334 325 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 IHHQ14623 411 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CLEC14AQ86T13 490 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 C10orf107Q8IVU9 208 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DENND6AQ8IWF6 608 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CNTN4Q8IWV2 1026 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PARP9Q8IXQ6 854 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CFAP52Q8N1V2 620 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PGBD5Q8N414 524 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TMEM237Q96Q45 408 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GPR22Q99680 433 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NACA2Q9H009 215 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RHOJQ9H4E5 214 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TREX1Q9NSU2 369 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 THAP1Q9NVV9 213 aa20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms