RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 GNLYP22749 145 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR12P47775 334 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCYT1AP49585 367 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 PMS2P54278 862 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q0VFX4 171 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD1Q15327 319 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF284Q2VY69 593 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 DENND1BQ6P3S1 775 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF367Q7RTV3 350 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMC8Q8IU68 726 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 HERC6Q8IVU3 1022 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 MIGA1Q8NAN2 632 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 SETD9Q8NE22 299 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM163Q8TC26 289 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 ELP5Q8TE02 316 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNFT2Q96EX2 444 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 MED30Q96HR3 178 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 COG8Q96MW5 612 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 ISCA1Q9BUE6 129 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 LHPPQ9H008 270 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITM2CQ9NQX7 267 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAI2Q9Y5P3 530 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 CKAP5Q14008 2032 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A096LPK6 155 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 VWA3AA6NCI4 1184 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC28A2O43868 658 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 WEE2P0C1S8 567 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLA2G2AP14555 144 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 HNF1BP35680 557 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 THPOP40225 353 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 HALP42357 657 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABATP80404 500 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 LTBQ06643 244 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 DSC1Q08554 894 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 EFR3AQ14156 821 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 HNF4GQ14541 408 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPE65Q16518 533 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 ME3Q16798 604 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXO47Q5MNV8 452 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 NCAPH2Q6IBW4 605 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADHFE1Q8IWW8 467 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP38Q8NB14 1042 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAAF1Q8NEP3 725 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM18Q96B42 140 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 SH3KBP1Q96B97 665 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 PHF21BQ96EK2 531 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 TWNKQ96RR1 684 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 MEIS3Q99687 375 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 HERPUD2Q9BSE4 406 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR26Q9H7D7 661 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPCSQ9HAB8 311 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 NLKQ9UBE8 527 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM157AC9JC47 383 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 PEX12O00623 359 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASAP2O43150 1006 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLK10O43240 276 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIP5K1CO60331 668 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAP00813 363 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 SERPINC1P01008 464 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRSS2P07478 247 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNPP09543 421 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 CBSLP0DN79 551 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 TGFB3P10600 412 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 CKMT1AP12532 417 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD72P21854 359 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNFRSF8P28908 595 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 CBSP35520 551 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUDT6P53370 316 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXO43Q4G163 708 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLHL22Q53GT1 634 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATG9BQ674R7 924 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 MON1BQ7L1V2 547 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD42Q8N9B4 389 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 TEX45Q8NA69 505 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR4N2Q8NGD1 307 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 RASSF8Q8NHQ8 419 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSPH1Q92598 858 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.9 ms