RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 GRK3P35626 688 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 NPY2RP49146 381 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 WNT7BP56706 349 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 JAM2P57087 298 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 CSHL1Q14406 222 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 NEPROQ6NW34 567 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ARHGAP24Q8N264 748 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 C3orf58Q8NDZ4 430 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 TEKT4Q8WW24 435 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 KLHL32Q96NJ5 620 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 COG4Q9H9E3 785 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ETNK2Q9NVF9 386 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 RAI2Q9Y5P3 530 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 MYH8P13535 1937 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 MAGEB16A2A368 324 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 C2orf78A6NCI8 922 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PMM2O15305 246 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 CD48P09326 243 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 KELP23276 732 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 CD151P48509 253 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ERVFC1P60507 584 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PHEXP78562 749 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ECT2LQ008S8 904 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 MGAT5Q09328 741 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 TBCCQ15814 346 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 AGAP9Q5VTM2 703 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM151BQ6UXP7 276 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 KCNMB4Q86W47 210 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 SERAC1Q96JX3 654 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 SYTL2Q9HCH5 934 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 TPRP12270 2363 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 SMCHD1A6NHR9 2005 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 SBF2Q86WG5 1849 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 MYH4Q9Y623 1939 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 EDIL3O43854 480 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 SNAP91O60641 907 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 ATG13O75143 517 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 BEST1O76090 585 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 EDN1P05305 212 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 MYL2P10916 166 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 HLA-EP13747 358 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 LPOP22079 712 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 PROZP22891 400 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 PBX1P40424 430 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 MAPKAPK2P49137 400 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 BMPR2Q13873 1038 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 ACAD11Q709F0 780 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 BBS7Q8IWZ6 715 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 MMGT1Q8N4V1 131 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 ACDQ96AP0 544 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 MED8Q96G25 268 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 PANX3Q96QZ0 392 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 KATNBL1Q9H079 304 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 GLOD4Q9HC38 313 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 GMEB2Q9UKD1 530 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 NCANO14594 1321 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 RASSF9O75901 435 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 PTPN3P26045 913 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 SSTR1P30872 391 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 RAP1GDS1P52306 607 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 DSC2Q02487 901 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 ELP6Q0PNE2 266 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 GRM3Q14832 879 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 TRIM68Q6AZZ1 485 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 LRRTM3Q86VH5 581 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 ELMO1Q92556 727 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 LMAN2LQ9H0V9 348 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 CAPN10Q9HC96 672 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 TAS2R13Q9NYV9 303 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 APPL1Q9UKG1 709 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 ACOT9Q9Y305 439 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 MYH7P12883 1935 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 GRIN2DO15399 1336 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 SHANK3Q9BYB0 1731 aa7.14□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 BCORQ6W2J9 1755 aa7.14□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 CDK14O94921 469 aa7.14□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 RPL22P35268 128 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LRRTM3-201ENST00000361320 PBX2P40425 430 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms