RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 TREHO43280 583 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 CD1EP15812 388 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 ADAM17P78536 824 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 PIGGQ5H8A4 983 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 PM20D1Q6GTS8 502 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM126BQ8IUX1 230 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 PGAM4Q8N0Y7 254 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 CNTD1Q8N815 330 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 DPF3Q92784 378 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 RNF34Q969K3 372 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 Q9H521 79 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF385DQ9H6B1 395 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 EFCAB1Q9HAE3 211 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC38A7Q9NVC3 462 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 CACNG3O60359 315 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 GABRB3P28472 473 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 RAB10P61026 200 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 ART3Q13508 389 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF423Q2M1K9 1284 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 CNTN4Q8IWV2 1026 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 USP33Q8TEY7 942 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 RCN3Q96D15 328 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 CATSPER2Q96P56 530 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 TBL1YQ9BQ87 522 aa21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 CAPN8A6NHC0 703 aa21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 TARM1B6A8C7 271 aa21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 DLX3O60479 287 aa21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 TADA2AO75478 443 aa21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 STMN1P16949 149 aa21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 THOP1P52888 689 aa21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 GCNAQ96QF7 691 aa21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 ZBTB26Q9HCK0 441 aa21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 XPR1Q9UBH6 696 aa21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 BTBD19C9JJ37 291 aa21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 CFLARO15519 480 aa21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 DENRO43583 198 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 AP1G1O43747 822 aa21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 ANXA9O76027 345 aa21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 VAPBO95292 243 aa21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 CCNCP24863 283 aa21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 LSMEM2Q8N112 164 aa21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 CATSPER1Q8NEC5 780 aa21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 RNF181Q9P0P0 153 aa21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 CDH9Q9ULB4 789 aa21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 PGGT1BP53609 377 aa21.78■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 UGT2A3Q6UWM9 527 aa21.78■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 SPATA22Q8NHS9 363 aa21.78■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 DCUN1D1Q96GG9 259 aa21.78■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.78■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 WDR41Q9HAD4 459 aa21.78■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM30AQ9NV96 361 aa21.78■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.78■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 HHLA1C9JL84 531 aa21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 DFFAO00273 331 aa21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 ME2P23368 584 aa21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 PSEN2P49810 448 aa21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 CTBP1Q13363 440 aa21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 POU6F1Q14863 301 aa21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM198Q66K66 360 aa21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 PLEKHH3Q7Z736 793 aa21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 DENND6AQ8IWF6 608 aa21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 CCNYL1Q8N7R7 359 aa21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 NPLOC4Q8TAT6 608 aa21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 NCSTNQ92542 709 aa21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 NXNL1Q96CM4 212 aa21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 FCRL5Q96RD9 977 aa21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 VCX3AQ9NNX9 186 aa21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 TRPC5OSA6NMA1 111 aa21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 NPHS1O60500 1241 aa21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 CNGA3Q16281 694 aa21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 FBXL19Q6PCT2 694 aa21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 BHLHA9Q7RTU4 235 aa21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 MARVELD2Q8N4S9 558 aa21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1-201ENST00000337004 IPMKQ8NFU5 416 aa21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms