RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317623.8

PCNX4-201, Transcript of pecanex 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene PCNX4, Length 17,339 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4-201ENST00000317623 J3QRK9 145 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 TBX3O15119 743 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 ACADLP28330 430 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 SEMA3AQ14563 771 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 TTLL9Q3SXZ7 439 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 P2RY8Q86VZ1 359 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 CDK20Q8IZL9 346 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 FNDC8Q8TC99 324 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 FBXL8Q96CD0 374 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 M0R036 132 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 AIREO43918 545 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 PLA2G6O60733 806 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 GJB6O95452 261 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 PFKFB4Q16877 469 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 FBXO39Q8N4B4 442 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 FCGR1BQ92637 280 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 COPS4Q9BT78 406 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 ARMC7Q9H6L4 198 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 NMRK2Q9NPI5 230 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 PSME2Q9UL46 239 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 FGFR2P21802 821 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 PLK1P53350 603 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 DPP9Q86TI2 863 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 DNAAF5Q86Y56 855 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 ZNF609O15014 1411 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 SH3D21A4FU49 640 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 CENPBD1B2RD01 187 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 HOXD12P35452 270 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 ARHGEF6Q15052 776 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 ACTR8Q9H981 624 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 ERVV-1B6SEH8 477 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 PRKCBP05771 671 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 KCNMB4Q86W47 210 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 VPS35Q96QK1 796 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 ALG5Q9Y673 324 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 SPTLC1O15269 473 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 DSG3P32926 999 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 PTPN5P54829 565 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 SCGNO76038 276 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 PEPDP12955 493 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 GRB10Q13322 594 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 C1orf189Q5VU69 101 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 USP43Q70EL4 1123 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 TRIM64BA6NI03 449 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 TBX1O43435 398 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 PSKH1P11801 424 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 ULK3Q6PHR2 472 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 FAM136AQ96C01 138 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 ABCB9Q9NP78 766 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 MAU2Q9Y6X3 613 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 GRIN2AQ12879 1464 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 KBTBD13C9JR72 458 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 IGFBP5P24593 272 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 PRELID2Q8N945 189 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 RFT1Q96AA3 541 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 RDH8Q9NYR8 311 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 SLC22A3O75751 556 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 SPESP1Q6UW49 350 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 SENP2Q9HC62 589 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 NCAM2O15394 837 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 CST1P01037 141 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 ZNF24P17028 368 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 GABRB2P47870 512 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 NAGLUP54802 743 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 TUBB3Q13509 450 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 ACSBG2Q5FVE4 666 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 FAM76BQ5HYJ3 339 aa6.67□□□□□ -1.34
PCNX4-201ENST00000317623 MCOLN2Q8IZK6 566 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms