RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216014.8

KDELR3-201, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 1,728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-201ENST00000216014 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 KIAA1211LQ6NV74 962 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 CCDC114Q96M63 670 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 CD248Q9HCU0 757 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 PI15O43692 258 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 METTL18O95568 372 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 MMP2P08253 660 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 DSC2Q02487 901 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 SIGLEC14Q08ET2 396 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 ACCSLQ4AC99 568 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 TEX44Q53QW1 395 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 FAXCQ5TGI0 409 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 PJA1Q8NG27 643 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 OR2A12Q8NGT7 310 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 ARRDC2Q8TBH0 407 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 TEKT5Q96M29 485 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 PSKH2Q96QS6 385 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 PLA2G4CQ9UP65 541 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 TTLL3Q9Y4R7 772 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 BNIP3LO60238 219 aa20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 IFNB1P01574 187 aa20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 NFKB1P19838 968 aa20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 CR2P20023 1033 aa20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 CHRNA3P32297 505 aa20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 RPL22P35268 128 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 FNTAP49354 379 aa20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 VASPP50552 380 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 SLC20A2Q08357 652 aa20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 C9orf64Q5T6V5 341 aa20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 TRIM67Q6ZTA4 783 aa20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 CHPFQ8IZ52 775 aa20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 HINFPQ9BQA5 517 aa20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 MGME1Q9BQP7 344 aa20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 PCYOX1Q9UHG3 505 aa20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 A0A1W2PQF6 199 aa20.28■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 C5orf60A6NFR6 353 aa20.28■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 TTI1O43156 1089 aa20.28■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 SIN3BO75182 1162 aa20.28■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 DCNP07585 359 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 RENBPP51606 427 aa20.28■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 METAP1P53582 386 aa20.28■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 RHOAP61586 193 aa20.28■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 TUBB2AQ13885 445 aa20.28■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF235Q14590 738 aa20.28■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 TMEM92Q6UXU6 159 aa20.28■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa20.28■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 ATL2Q8NHH9 583 aa20.28■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.28■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 SHDQ96IW2 340 aa20.28■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 SPATA13Q96N96 652 aa20.28■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.28■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 SLC6A17Q9H1V8 727 aa20.28■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 HOMER3Q9NSC5 361 aa20.28■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 SEPT3Q9UH03 358 aa20.28■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 CCDC188H7C350 402 aa20.27■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 RAD51CO43502 376 aa20.27■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 GCATO75600 419 aa20.27■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 CTSLP07711 333 aa20.27■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 VPS41P49754 854 aa20.27■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 OLIG2Q13516 323 aa20.27■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.27■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 FLCNQ8NFG4 579 aa20.27■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 UCMAQ8WVF2 138 aa20.27■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 GABRG3Q99928 467 aa20.27■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 NOD2Q9HC29 1040 aa20.27■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 GLOD4Q9HC38 313 aa20.27■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 PRSS16Q9NQE7 514 aa20.27■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa20.27■□□□□ 0.84
KDELR3-201ENST00000216014 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa20.27■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 EPHX1P07099 455 aa20.27■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 PSMB4P28070 264 aa20.27■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 TERF1P54274 439 aa20.27■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 PID1Q7Z2X4 250 aa20.27■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 STK40Q8N2I9 435 aa20.27■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 FAM129BQ96TA1 746 aa20.27■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 SEMA3CQ99985 751 aa20.27■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 CEP44Q9C0F1 390 aa20.27■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 UBP1Q9NZI7 540 aa20.27■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 STK25O00506 426 aa20.26■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 NTSR1P30989 418 aa20.26■□□□□ 0.83
KDELR3-201ENST00000216014 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms