RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000204679.8

GNPTG-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTG, Length 1,983 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTG-201ENST00000204679 MMP2P08253 660 aa23.49■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 CNTFP26441 200 aa23.49■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 NEK3P51956 506 aa23.49■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 PCID2Q5JVF3 399 aa23.49■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 TMCO4Q5TGY1 634 aa23.49■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 ZNF449Q6P9G9 518 aa23.49■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 GAREM2Q75VX8 874 aa23.49■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 SPON2Q9BUD6 331 aa23.49■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 RETREG1Q9H6L5 497 aa23.49■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 PDFQ9HBH1 243 aa23.49■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 MYLKQ15746 1914 aa23.48■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 SYN1P17600 705 aa23.48■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 CTNNB1P35222 781 aa23.48■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 TNK2Q07912 1038 aa23.48■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 IHHQ14623 411 aa23.48■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa23.48■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 KCNMB4Q86W47 210 aa23.48■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa23.48■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 SLC25A41Q8N5S1 370 aa23.48■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 KREMEN2Q8NCW0 462 aa23.48■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 AGAP2Q99490 1192 aa23.48■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 CPQQ9Y646 472 aa23.48■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 HIDE1A8MVS5 230 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 ZXDBP98169 803 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 ZNF235Q14590 738 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 PDK4Q16654 411 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 PKN3Q6P5Z2 889 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 CCDC149Q6ZUS6 474 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 PIGWQ7Z7B1 504 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 ARRDC2Q8TBH0 407 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 SPOCK2Q92563 424 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 FAM111AQ96PZ2 611 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 SLC13A1Q9BZW2 595 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 VPS45Q9NRW7 570 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 PCMTD2Q9NV79 361 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 ACTL7AQ9Y615 435 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 A0A1B0GVM2 712 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 WDR91A4D1P6 747 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 TCAF2A6NFQ2 919 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 GJB3O75712 270 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 RHOCP08134 193 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 F7P08709 466 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 PLPP4Q5VZY2 271 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 CHST9Q7L1S5 443 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 CPNE1Q99829 537 aa23.47■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 GOLGA8TH3BQL2 631 aa23.46■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 MUSKO15146 869 aa23.46■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 OLFM2O95897 454 aa23.46■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 GLDCP23378 1020 aa23.46■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 BMPR1AP36894 532 aa23.46■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 GP5P40197 560 aa23.46■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 CCNFP41002 786 aa23.46■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa23.46■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 POTEHQ6S545 545 aa23.46■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 FAM47EQ6ZV65 393 aa23.46■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 TMC8Q8IU68 726 aa23.46■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 NDUFAF2Q8N183 169 aa23.46■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 MAB21L3Q8N8X9 362 aa23.46■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 SEMA3CQ99985 751 aa23.46■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa23.46■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 LRRC3Q9BY71 257 aa23.46■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 STOML2Q9UJZ1 356 aa23.46■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 ITGA2BP08514 1039 aa23.45■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 OXCT1P55809 520 aa23.45■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 DNAJC3Q13217 504 aa23.45■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 TIFABQ6ZNK6 161 aa23.45■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 STRA8Q7Z7C7 330 aa23.45■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 LRRC8CQ8TDW0 803 aa23.45■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 ZNF599Q96NL3 588 aa23.45■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 MCOLN1Q9GZU1 580 aa23.45■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
GNPTG-201ENST00000204679 ILVBLA1L0T0 632 aa23.45■■□□□ 1.34
GNPTG-201ENST00000204679 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
GNPTG-201ENST00000204679 CKMP06732 381 aa23.45■■□□□ 1.34
GNPTG-201ENST00000204679 DNAJB1P25685 340 aa23.45■■□□□ 1.34
GNPTG-201ENST00000204679 SEPT6Q14141 434 aa23.45■■□□□ 1.34
GNPTG-201ENST00000204679 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
GNPTG-201ENST00000204679 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
GNPTG-201ENST00000204679 HERVK_113Q902F9 699 aa23.45■■□□□ 1.34
GNPTG-201ENST00000204679 CABS1Q96KC9 395 aa23.45■■□□□ 1.34
GNPTG-201ENST00000204679 ATP13A1Q9HD20 1204 aa23.45■■□□□ 1.34
GNPTG-201ENST00000204679 TCAF1Q9Y4C2 921 aa23.45■■□□□ 1.34
GNPTG-201ENST00000204679 DENND4CQ5VZ89 1909 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTG-201ENST00000204679 C2orf71A6NGG8 1288 aa23.44■■□□□ 1.34
GNPTG-201ENST00000204679 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms