RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039061.14

Trappc11-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc11, Length 4,332 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Mknk1O08605 427 aa11.66□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ifnar2O35664 513 aa11.66□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Trafd1Q3UDK1 580 aa11.66□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Arhgef9Q3UTH8 516 aa11.66□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Akr1clQ3UXL1 322 aa11.66□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Osbp2Q5QNQ6 908 aa11.66□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 RasefQ5RI75 627 aa11.66□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Grid2Q61625 1007 aa11.66□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ugt2a1Q80X89 528 aa11.66□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Cxcr1Q810W6 351 aa11.66□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Tmem260Q8BMD6 703 aa11.66□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Pggt1bQ8BUY9 377 aa11.66□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Clptm1lQ8BXA5 539 aa11.66□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 DnerQ8JZM4 737 aa11.66□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Acsm2Q8K0L3 575 aa11.66□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ddx28Q9CWT6 540 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Tmx2Q9D710 295 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Chst7Q9EP78 484 aa11.66□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Slc29a1Q9JIM1 460 aa11.66□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Txnrd2Q9JLT4 524 aa11.66□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Grm3Q9QYS2 879 aa11.66□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Cdh22Q9WTP5 813 aa11.66□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 MycsQ9Z304 431 aa11.66□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Bub1O08901 1058 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 DdcO88533 480 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 RapsnP12672 412 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Sat1P48026 171 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Kansl1lQ5DTI6 991 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ndrg1Q62433 394 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Pcdhga7Q6DD96 935 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Olfr533Q7TRT7 320 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Sema3dQ8BH34 777 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Brat1Q8C3R1 822 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Evi2bQ8VD58 444 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Olfr1325Q8VF43 315 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Oas1dQ8VI95 361 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Fig4Q91WF7 907 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Far1Q922J9 515 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ecrg4Q99LS0 148 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Pbld2Q9CXN7 288 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Chaf1bQ9D0N7 572 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Pi16Q9ET66 489 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Egfl7Q9QXT5 275 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gm28363A0A087WQW2 129 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 4921501E09RikA0A0R4J054 908 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Vmn1r39G3UWE6 305 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 St3gal1P54751 337 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Bace1P56818 501 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gm1587Q3UT80 123 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Srbd1Q497V5 1015 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Nr1d2Q60674 576 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Stk40Q7TNL3 435 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Olfr299Q7TS05 330 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Rsbn1Q80T69 795 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Pdzph1Q8BGR1 1238 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Klhl26Q8BGY4 606 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ipo11Q8K2V6 975 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Pcdhb13Q91Y06 796 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Q99LU8 229 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Nck1Q99M51 377 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 ProzQ9CQW3 399 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Dcp2Q9CYC6 422 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Twf2Q9Z0P5 349 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Magea6O89010 325 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Jak1P52332 1153 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Cd300lgQ1ERP8 331 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Slc20a1Q61609 681 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ssx9Q6XAS3 170 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ssxb3Q6XAS4 170 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Plppr4Q7TME0 766 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Far2Q7TNT2 515 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Sgo2Q7TSY8 1164 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Noc4lQ8BHY2 516 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 GancQ8BVW0 898 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Rnf8Q8VC56 488 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Olfr385Q8VGT1 312 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 DhddsQ99KU1 333 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Map3k20Q9ESL4 802 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Adam17Q9Z0F8 827 aa11.65□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 S100zB9EJL3 99 aa11.64□□□□□ -0.55
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ces1bD3Z5G7 567 aa11.64□□□□□ -0.55
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Mtf2Q02395 593 aa11.64□□□□□ -0.55
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ebf1Q07802 591 aa11.64□□□□□ -0.55
Trappc11-201ENSMUST00000039061 IqcmQ149I8 489 aa11.64□□□□□ -0.55
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Kcnh1Q60603 989 aa11.64□□□□□ -0.55
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Runx1t1Q61909 577 aa11.64□□□□□ -0.55
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Olfr23Q7TRX4 325 aa11.64□□□□□ -0.55
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Slc9a4Q8BUE1 797 aa11.64□□□□□ -0.55
Trappc11-201ENSMUST00000039061 4933409G03RikQ8C5U0 320 aa11.64□□□□□ -0.55
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Mcrs1Q99L90 462 aa11.64□□□□□ -0.55
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Q9D4A5 307 aa11.64□□□□□ -0.55
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Vps35Q9EQH3 796 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Htr3bQ9JHJ5 437 aa11.64□□□□□ -0.55
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Limd1Q9QXD8 668 aa11.64□□□□□ -0.55
Trappc11-201ENSMUST00000039061 DccP70211 1447 aa11.64□□□□□ -0.55
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Galntl6E5D8G1 601 aa11.64□□□□□ -0.55
Trappc11-201ENSMUST00000039061 F6Y6L6 278 aa11.64□□□□□ -0.55
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Vmn2r70K7N702 854 aa11.64□□□□□ -0.55
Trappc11-201ENSMUST00000039061 C1qbP14106 253 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.4 ms