RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC2A13Q96QE2 648 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 TNKS2Q9H2K2 1166 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS51Q9UID3 782 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 CNTN6Q9UQ52 1028 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 HSF2BPO75031 334 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 TGM2P21980 687 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 MTA1Q13330 715 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ARSIQ5FYB1 569 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 EFHC1Q5JVL4 640 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 CRTC1Q6UUV9 634 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 LINGO4Q6UY18 593 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM174AQ8TBP5 190 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ACP6Q9NPH0 428 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 IL36AQ9UHA7 158 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC28A2O43868 658 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 PAGE1O75459 146 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 CNTN5O94779 1100 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ENDOD1O94919 500 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 GLI1P08151 1106 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 USP8P40818 1118 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 GUSBP11Q6P575 273 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMB7Q99436 277 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ADCY5O95622 1261 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 NEK3P51956 506 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 FZD2Q14332 565 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB133Q30KQ1 61 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM259Q4ZIN3 620 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 C22orf39Q6P5X5 142 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 PARGQ86W56 976 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 PASD1Q8IV76 773 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 LMX1AQ8TE12 382 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 BMFQ96LC9 184 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 CPXM1Q96SM3 734 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 HDAC8Q9BY41 377 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ASNSD1Q9NWL6 643 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 POM121BA6NF01 834 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF103O00237 685 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 AFPP02771 609 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 CSF2P04141 144 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS21P63220 83 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNC4Q03721 635 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 MED8Q96G25 268 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC17A9Q9BYT1 436 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-217ENST00000629983 M0QYT0 321 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 AQP9O43315 295 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 LEFTY1O75610 366 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT10P13645 584 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 NME1P15531 152 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 DNA2P51530 1060 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 CLCN6P51797 869 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 NR0B2Q15466 257 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 ALFQ53S48 1182 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC81Q6ZN84 652 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 DCAF4L2Q8NA75 395 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 FEM1CQ96JP0 617 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC46A1Q96NT5 459 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 IL12RB2Q99665 862 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 K7ENP7 123 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 CD44P16070 742 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 JUNDP17535 347 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 RABIFP47224 123 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 IGF2-ASQ6U949 168 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 GRAMD1AQ96CP6 724 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 SYNCQ9H7C4 482 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 SNX10Q9Y5X0 201 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 CYSRT1A8MQ03 144 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 FPGTO14772 594 aa27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms