RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 RRP8O43159 456 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 SCNN1AP37088 669 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 ARSIQ5FYB1 569 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 C22orf39Q6P5X5 142 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 OR13H1Q8NG92 308 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 C18orf8Q96DM3 657 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 TNKS2Q9H2K2 1166 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 PRORYQ9H606 182 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 IL36AQ9UHA7 158 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 PCDH8O95206 1070 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 OR1E1P30953 314 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 MAN2A1Q16706 1144 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM259Q4ZIN3 620 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 HS1BP3Q53T59 392 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 MLKLQ8NB16 471 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 OR7D4Q8NG98 312 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 BAP1Q92560 729 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 FGF11Q92914 225 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 CALN1Q9BXU9 219 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF212Q9UDV6 495 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 ILVBLA1L0T0 632 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 BRINP1O60477 761 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 PIAS2O75928 621 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 MT-CO3P00414 261 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 GIMD1P0DJR0 217 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 CLDN2P57739 230 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 DAB2P98082 770 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 SEL1L3Q68CR1 1132 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 GCNT7Q6ZNI0 430 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 XYLT1Q86Y38 959 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 IFT43Q96FT9 208 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 PDCL3Q9H2J4 239 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 CAAP1Q9H8G2 361 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 RAI2Q9Y5P3 530 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 WASF2Q9Y6W5 498 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRF-216ENST00000617451 FFAR2O15552 330 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 LEFTY1O75610 366 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 ZMPSTE24O75844 475 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 CYP11B1P15538 503 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 FLT3P36888 993 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF783Q6ZMS7 281 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 BNIPLQ7Z465 357 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 ERICH1Q86X53 443 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 FAM174AQ8TBP5 190 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R16AQ96I34 528 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 HAPLN3Q96S86 360 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 CEP44Q9C0F1 390 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 NDST4Q9H3R1 872 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 SRGAP2O75044 1071 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 ENDOD1O94919 500 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 CKMT1AP12532 417 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 SLC20A2Q08357 652 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 TRNP1Q6NT89 227 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 RETSATQ6NUM9 610 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 Q6ZSR6 202 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 SPON2Q9BUD6 331 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 TRPM6Q9BX84 2022 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 DOCK4Q8N1I0 1966 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 SHROOM3Q8TF72 1996 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 MGAQ8IWI9 3026 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 ACTN2P35609 894 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 NEK3P51956 506 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 UBE2HP62256 183 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 RAPGEF1Q13905 1077 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D25Q3MII6 688 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 VWA3BQ502W6 1294 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 MIIPQ5JXC2 388 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 KDM7AQ6ZMT4 941 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 TMC6Q7Z403 805 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 BMFQ96LC9 184 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 SLC17A9Q9BYT1 436 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 GPR27Q9NS67 375 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 NLGN3Q9NZ94 848 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM59LQ9UK28 342 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 A6NNZ2 444 aa25.42■■□□□ 1.66
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PTPRF-216ENST00000617451 ADRB3P13945 408 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 ITGB7P26010 798 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 RPS21P63220 83 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 ARF5P84085 180 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRF-216ENST00000617451 FGL2Q14314 439 aa25.42■■□□□ 1.66
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