RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613916.1

PVT1-222, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 137 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-222	ENST00000613916	MAGEA4	P43358	317 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	CDH4	P55283	916 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	SERINC3	Q13530	473 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	SLC29A2	Q14542	456 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	HIF1A	Q16665	826 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	KYNU	Q16719	465 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	PARP6	Q2NL67	630 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	CFAP58	Q5T655	872 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	RNF43	Q68DV7	783 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	KCTD11	Q693B1	232 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	PID1	Q7Z2X4	250 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	CPXM2	Q8N436	756 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	LEMD2	Q8NC56	503 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	OR7D4	Q8NG98	312 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	USP33	Q8TEY7	942 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	EXOC4	Q96A65	974 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	C9orf72	Q96LT7	481 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	SERPINB12	Q96P63	405 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	GCNA	Q96QF7	691 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	VAT1	Q99536	393 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	GBA3	Q9H227	469 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	PDF	Q9HBH1	243 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	DONSON	Q9NYP3	566 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916		A0A0D9SEW6	157 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916		A0A1B0GVM2	712 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	PRAMEF11	O60813	436 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	RAMP2	O60895	175 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	TBL1X	O60907	577 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	AVIL	O75366	819 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	CLDN11	O75508	207 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	PRAMEF12	O95522	483 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	HLA-DQB2	P05538	268 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	APRT	P07741	180 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	TCF3	P15923	654 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	AOC1	P19801	751 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	NFKB1	P19838	968 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	IFNAR2	P48551	515 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	ARL4C	P56559	192 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	GPX6	P59796	221 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	CDK16	Q00536	496 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	GNA12	Q03113	381 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	TNK2	Q07912	1038 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	IL10RB	Q08334	325 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF844	Q08AG5	666 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	USP4	Q13107	963 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	MTM1	Q13496	603 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	OLIG2	Q13516	323 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	IHH	Q14623	411 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	ANGPT1	Q15389	498 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF77	Q15935	545 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	PARP15	Q460N3	678 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	TEX26	Q8N6G2	289 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	ITFG1	Q8TB96	612 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	ING5	Q8WYH8	240 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	ARL8A	Q96BM9	186 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	ALG14	Q96F25	216 aa		7.47	□□□□□ -1.21
PVT1-222	ENST00000613916	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21

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