RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 HDAC8Q9BY41 377 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 TKTL2Q9H0I9 626 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 CAAP1Q9H8G2 361 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 ANLNQ9NQW6 1124 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 DYRK4Q9NR20 520 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 GPR27Q9NS67 375 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 RRN3Q9NYV6 651 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 NLGN3Q9NZ94 848 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A0D9SEW6 157 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 NEMP2A6NFY4 417 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 DRGXA6NNA5 263 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 A6NNZ2 444 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 OPA1O60313 960 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 DXOO77932 396 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 PCDH8O95206 1070 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 MPOP05164 745 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 GP1BAP07359 652 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 CXCR3P49682 368 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 SNX16P57768 344 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 CXADRP78310 365 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 PTK2Q05397 1052 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 EXOC3L4Q17RC7 722 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 ARSIQ5FYB1 569 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 SEL1L3Q68CR1 1132 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 SMYD5Q6GMV2 418 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 C22orf39Q6P5X5 142 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 PCSK4Q6UW60 755 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 LINGO4Q6UY18 593 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 GBP6Q6ZN66 633 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 Q6ZSR6 202 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF843Q8N446 348 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM181AQ8N9Y4 354 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 NT5C3BQ969T7 300 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP1R16AQ96I34 528 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 BMFQ96LC9 184 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 DEPDC7Q96QD5 511 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 DUSP23Q9BVJ7 150 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 WDCPQ9H6R7 721 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 USP29Q9HBJ7 922 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 IL36AQ9UHA7 158 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 STAP1Q9ULZ2 295 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 U3KQA8 63 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-226ENST00000593200 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 POM121BA6NF01 834 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 K7ESM1 405 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 ERVH48-1M5A8F1 160 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 SCAMP1O15126 338 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 USP12O75317 370 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 CSO75390 466 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 LEFTY1O75610 366 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 MYF5P13349 255 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 ADRB3P13945 408 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 PON1P27169 355 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 CLCN1P35523 988 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 KRT9P35527 623 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 SULT1E1P49888 294 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 NEK3P51956 506 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 ERVPABLB-1P60509 514 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 GABREP78334 506 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 FGL2Q14314 439 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 FZD2Q14332 565 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF542PQ5EBM4 170 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 ARTNQ5T4W7 220 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC31Q6UY01 552 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC47A2Q86VL8 602 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 LSMEM2Q8N112 164 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 OR7D4Q8NG98 312 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 C1orf74Q96LT6 269 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC17A9Q9BYT1 436 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 TNKS2Q9H2K2 1166 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 SYNCQ9H7C4 482 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 PLCB1Q9NQ66 1216 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 EVA1BQ9NVM1 165 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 DNAJC28Q9NX36 388 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 MPP6Q9NZW5 540 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF212Q9UDV6 495 aa10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms