RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-210ENST00000578916 TMIEQ8NEW7 156 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-210ENST00000578916 BTN2A2Q8WVV5 523 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-210ENST00000578916 NAT6Q93015 286 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-210ENST00000578916 ALG14Q96F25 216 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-210ENST00000578916 SEMA3CQ99985 751 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC3Q9BQI4 270 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-210ENST00000578916 FEM1AQ9BSK4 669 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-210ENST00000578916 TRIM62Q9BVG3 475 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-210ENST00000578916 SLC17A9Q9BYT1 436 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-210ENST00000578916 ST7Q9NRC1 585 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-210ENST00000578916 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-210ENST00000578916 SPASTQ9UBP0 616 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-210ENST00000578916 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-210ENST00000578916 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-210ENST00000578916 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 FPGTO14772 594 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 CETN3O15182 167 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 NOBOXO60393 691 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 RHOBTB3O94955 611 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 PRNPP04156 253 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 GP1BBP13224 206 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 RABIFP47224 123 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 PDX1P52945 283 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 RPS21P63220 83 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 KRT83P78385 493 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 TLE1Q04724 770 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 TGIF1Q15583 401 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 TBR1Q16650 682 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 MANEAQ5SRI9 462 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 BEND5Q7L4P6 421 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 RAB11FIP2Q7L804 512 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 UBR7Q8N806 425 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 POM121Q96HA1 1249 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 PPP1R16AQ96I34 528 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 FEM1CQ96JP0 617 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 BOCQ9BWV1 1114 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 HDAC8Q9BY41 377 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 STRADBQ9C0K7 418 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 MUC3BQ9H195 1237 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 EPB41L5Q9HCM4 733 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 GPR27Q9NS67 375 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 SEPT10Q9P0V9 454 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 USP25Q9UHP3 1055 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 KLF15Q9UIH9 416 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 COQ4Q9Y3A0 265 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 PTPN13Q12923 2485 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 CASC3O15234 703 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 RAD51BO15315 384 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 MT-CO1P00395 513 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 ANXA6P08133 673 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 PRR29P0C7W0 189 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 LIPCP11150 499 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 SLC2A3P11169 496 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 SRCP12931 536 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 UGT1A5P35504 534 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 ACADSBP45954 432 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 NEK3P51956 506 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 ADKP55263 362 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 CENPCQ03188 943 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 SGCGQ13326 291 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 EDRF1Q3B7T1 1238 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 ZCWPW2Q504Y3 356 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 ARSIQ5FYB1 569 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 FBXL22Q6P050 247 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 SLC35F3Q8IY50 421 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 OR52K2Q8NGK3 314 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 OR2A12Q8NGT7 310 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 ZSWIM1Q9BR11 485 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 SLC25A18Q9H1K4 315 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 FAM204AQ9H8W3 233 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 POPDC2Q9HBU9 364 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 IL36AQ9UHA7 158 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 PADI4Q9UM07 663 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 HS3ST2Q9Y278 367 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1B0GVL5 298 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 K7ERQ8 282 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 SNAP91O60641 907 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 CLDN11O75508 207 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 GCATO75600 419 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 CALCAP01258 141 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-210ENST00000578916 IGLV3-25P01717 112 aa9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms