RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524705.2

BBS1-205, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 3

Gene BBS1, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-205	ENST00000524705	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	IPMK	Q8NFU5	416 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	DDI1	Q8WTU0	396 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ING5	Q8WYH8	240 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	LRRC39	Q96DD0	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PGM2	Q96G03	612 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	GDF15	Q99988	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	FICD	Q9BVA6	458 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MUC3B	Q9H195	1237 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	IGFLR1	Q9H665	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TASP1	Q9H6P5	420 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PIDD1	Q9HB75	910 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PDF	Q9HBH1	243 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	BFAR	Q9NZS9	450 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MSRA	Q9UJ68	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CCL26	Q9Y258	94 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	NUP205	Q92621	2012 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CBX4	O00257	560 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	GFRA2	O00451	464 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	UGT1A9	O60656	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CDH16	O75309	829 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	FAM155B	O75949	473 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ANXA9	O76027	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PRAMEF12	O95522	483 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	C1QA	P02745	245 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MMP2	P08253	660 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CEBPB	P17676	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PFKL	P17858	780 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PGAM1	P18669	254 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	STX2	P32856	288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ADRA1A	P35348	466 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CSK	P41240	450 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CD86	P42081	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	RGR	P47804	291 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	NPY2R	P49146	381 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	WNT3A	P56704	352 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	PPP2R2A	P63151	447 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ARF5	P84085	180 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	SKOR1	P84550	965 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	GUCY1A3	Q02108	690 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TNK2	Q07912	1038 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CDH17	Q12864	832 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MPP3	Q13368	585 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CDH18	Q13634	790 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	ZNF235	Q14590	738 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CYTH1	Q15438	398 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	RAB30	Q15771	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MPPE1	Q53F39	396 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	STEAP4	Q687X5	459 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	KDELC1	Q6UW63	502 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	LINGO4	Q6UY18	593 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	LINC00523	Q86TU6	105 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	RNF135	Q8IUD6	432 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	MFN1	Q8IWA4	741 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	APCDD1	Q8J025	514 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	CPXM2	Q8N436	756 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS1-205	ENST00000524705	TEX26	Q8N6G2	289 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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