RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM198Q66K66 360 aa27.51■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 DNAJB3Q8WWF6 145 aa27.51■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 SCYL1Q96KG9 808 aa27.51■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 OR12D3Q9UGF7 316 aa27.51■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 SNX10Q9Y5X0 201 aa27.51■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 DDHD2O94830 711 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 AHSGP02765 367 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 USP17L7P0C7H9 530 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC35E2BP0CK96 405 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 AVPR1AP37288 418 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 FLOT2Q14254 428 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF423Q2M1K9 1284 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 PIGGQ5H8A4 983 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 KCTD4Q8WVF5 259 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 GABRDO14764 452 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 AP1G2O75843 785 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 GABRB3P28472 473 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 HK2P52789 917 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 SNX17Q15036 470 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 RCN3Q96D15 328 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 KIFC1Q9BW19 673 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 CFLARO15519 480 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 JUNP05412 331 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 GJA5P36382 358 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 SNAPC2Q13487 334 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 TLR1Q15399 786 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 NXNQ6DKJ4 435 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 STYXQ8WUJ0 223 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 WDCPQ9H6R7 721 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 CRTAC1Q9NQ79 661 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 IPPQ9Y573 584 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 C9IYK1 514 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC22A2O15244 555 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 PRKAA2P54646 552 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 GJA9P57773 515 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC12A1Q13621 1099 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 OTOP3Q7RTS5 596 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 DPP9Q86TI2 863 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 LSMEM2Q8N112 164 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 DCUN1D1Q96GG9 259 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 CATSPER2Q96P56 530 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 TSPAN18Q96SJ8 248 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF385DQ9H6B1 395 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 VTI1BQ9UEU0 232 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 VPS28Q9UK41 221 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 CDYLQ9Y232 598 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 TARM1B6A8C7 271 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 PKNOX1P55347 436 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 SMOQ99835 787 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 TSC2P49815 1807 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 SLCO1B7G3V0H7 640 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 DENRO43583 198 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 AP1G1O43747 822 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 STRNO43815 780 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 LRIG2O94898 1065 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 MS4A2Q01362 244 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 PRPSAP1Q14558 356 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 ARPINQ7Z6K5 226 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 RNF148Q8N7C7 305 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 CNTD1Q8N815 330 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 EDEM1Q92611 657 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 DPF3Q92784 378 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 LRGUKQ96M69 825 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 TKTL2Q9H0I9 626 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 CNGB3Q9NQW8 809 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM30AQ9NV96 361 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 CEACAM7Q14002 265 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 EPAS1Q99814 870 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 ZBTB26Q9HCK0 441 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 ACOT9Q9Y305 439 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 BPTFQ12830 3046 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 UNCXA6NJT0 531 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 AP3B1O00203 1094 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-221ENST00000511747 DLX3O60479 287 aa27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms