RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	C6	P13671	934 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	GOT1	P17174	413 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ACP1	P24666	158 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC25B	P30305	580 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	NNMT	P40261	264 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	RXRG	P48443	463 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	SGSH	P51688	502 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ADPRH	P54922	357 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ADIG	Q0VDE8	80 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNJ12	Q14500	433 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB41	Q5JT25	222 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	MPP7	Q5T2T1	576 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	SHC4	Q6S5L8	630 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	RFFL	Q8WZ73	363 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCG4	Q9H172	646 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	CISH	Q9NSE2	258 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC34	A8MYJ7	566 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	USP12	O75317	370 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	LCP1	P13796	627 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	CD19	P15391	556 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	C5AR1	P21730	350 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP2CB	P62714	309 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP2CA	P67775	309 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	STK4	Q13043	487 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	TMC6	Q7Z403	805 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC17	Q96AE7	1141 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	THSD1	Q9NS62	852 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	MTMR6	Q9Y217	621 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511		E7ENQ6	273 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM38	O00635	465 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	FFAR2	O15552	330 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ACSL4	O60488	711 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	ALPPL2	P10696	532 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	NR2F2	P24468	414 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	MAPK1	P28482	360 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	RAD23B	P54727	409 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	TBX4	P57082	545 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	NUCB2	P80303	420 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP3CA	Q08209	521 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	CUL4A	Q13619	759 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	SGO2	Q562F6	1265 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	IQCH	Q86VS3	1027 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	STK40	Q8N2I9	435 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	KDM1B	Q8NB78	822 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	TENM4	Q6N022	2769 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511		F8W735	103 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	TULP2	O00295	520 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SKAP2-209	ENST00000497511	CS	O75390	466 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62

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