RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494570.1

KDM4C-211, Transcript of lysine demethylase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene KDM4C, Length 647 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4C-211ENST00000494570 MUC3BQ9H195 1237 aa8.4□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 RETREG1Q9H6L5 497 aa8.4□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 FBRSQ9HAH7 460 aa8.4□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 VPS45Q9NRW7 570 aa8.4□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 MYO1AQ9UBC5 1043 aa8.4□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 PCSK1NQ9UHG2 260 aa8.4□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 DNAI1Q9UI46 699 aa8.4□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 PPM1HQ9ULR3 514 aa8.4□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 USP18Q9UMW8 372 aa8.4□□□□□ -1.06
KDM4C-211ENST00000494570 NCOR2Q9Y618 2525 aa8.4□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 CKAP5Q14008 2032 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 SPTBN2O15020 2390 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 LNP1A1A4G5 178 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 ANKRD62A6NC57 917 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 METTL12A8MUP2 240 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 PLK4O00444 970 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 MCF2LO15068 1137 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 TPM3P06753 285 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 MAOBP27338 520 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 EPHB2P29323 1055 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 OXTRP30559 389 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 PCK1P35558 622 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 MAPKAPK2P49137 400 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 ZNF75DP51815 510 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 AIF1P55008 147 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 IRX4P78413 519 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 BNC1Q01954 994 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 TRIM14Q14142 442 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 CST6Q15828 149 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 EFHC2Q5JST6 749 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 ERMARDQ5T6L9 678 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 LYSMD4Q5XG99 296 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 AFMIDQ63HM1 303 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 FAM124AQ86V42 546 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 SYT12Q8IV01 421 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 CHST14Q8NCH0 376 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 CADM4Q8NFZ8 388 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 PIGKQ92643 395 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 TRIM11Q96F44 468 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 HMCESQ96FZ2 354 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 HSPA12BQ96MM6 686 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 PPP1R9BQ96SB3 815 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 SPON2Q9BUD6 331 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 NUP85Q9BW27 656 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 GPR174Q9BXC1 333 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 NEUROG2Q9H2A3 272 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 LRRC19Q9H756 370 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 EBF2Q9HAK2 575 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 CAPN10Q9HC96 672 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 FSCN3Q9NQT6 498 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 SCINQ9Y6U3 715 aa8.39□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 A0A1W2PP55 124 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 CBX4O00257 560 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 KDELR3O43731 214 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 CREB3O43889 395 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 IGHV4-34P06331 123 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 ACADMP11310 421 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 GOT1P17174 413 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 IL4RP24394 825 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 SLC8A1P32418 973 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 ARSEP51690 589 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 KRT83P78385 493 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 LMNB2Q03252 620 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 DPYSQ14117 519 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 ACAP1Q15027 740 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 DPYSL2Q16555 572 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 DCAF12L1Q5VU92 463 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 SLC23A3Q6PIS1 610 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 LEKR1Q6ZMV7 388 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 USP30Q70CQ3 517 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 TP53INP2Q8IXH6 220 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 NPWQ8N729 165 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 ATP11CQ8NB49 1132 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 NETO2Q8NC67 525 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 FAM71BQ8TC56 605 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 TSC1Q92574 1164 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 MAGEH1Q9H213 219 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 TNKS2Q9H2K2 1166 aa8.38□□□□□ -1.07
KDM4C-211ENST00000494570 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.4 ms