RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	WASH4P	A8MWX3	477 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	KBTBD13	C9JR72	458 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247		E7ENQ6	273 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247		E7EVH7	732 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	SGK1	O00141	431 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ENPP3	O14638	875 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	RASGRF2	O14827	1237 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	DCLK1	O15075	740 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	PDPK1	O15530	556 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	TBC1D4	O60343	1298 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	B4GALT3	O60512	393 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	NBN	O60934	754 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	CDH16	O75309	829 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	SPAG6	O75602	509 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ZBED1	O96006	694 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	POMC	P01189	267 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	LTF	P02788	710 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	GSTA2	P09210	222 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	LCP1	P13796	627 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	CAPN2	P17655	700 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	TPSB2	P20231	275 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP5D	P30049	168 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	HOXC13	P31276	330 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ADRA1B	P35368	520 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	LMAN1	P49257	510 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	GLUD2	P49448	558 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	NDUFV1	P49821	464 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	SULT1E1	P49888	294 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	CACNA2D1	P54289	1103 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ARL4C	P56559	192 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	MAP3K7CL	P57077	242 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	PPP2R2A	P63151	447 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	CDK16	Q00536	496 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	TSPY1	Q01534	308 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	PRKCQ	Q04759	706 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF33A	Q06730	810 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	TNK2	Q07912	1038 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	SMARCB1	Q12824	385 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	SEMA5A	Q13591	1074 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	TPSAB1	Q15661	275 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	CDO1	Q16878	200 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	FBLN7	Q53RD9	439 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	KCTD16	Q68DU8	428 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	VSTM1	Q6UX27	236 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRC31	Q6UY01	552 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	CYS1	Q717R9	158 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	CENPU	Q71F23	418 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ABI1	Q8IZP0	508 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC185	Q8N715	623 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	MAML1	Q92585	1016 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	DPF3	Q92784	378 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRC39	Q96DD0	335 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	TOX2	Q96NM4	488 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	MED10	Q9BTT4	135 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	COMMD8	Q9NX08	183 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	DTL	Q9NZJ0	730 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	FNIP2	Q9P278	1114 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	GGA2	Q9UJY4	613 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	TSC2	P49815	1807 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	TLDC2	A0PJX2	215 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247		H3BS24	57 aa		5.7	□□□□□ -1.5

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