RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-206ENST00000487539 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 TEKT5Q96M29 485 aa4.81□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa4.81□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 TPSD1Q9BZJ3 242 aa4.81□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 ZFP14Q9HCL3 533 aa4.81□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 AKIP1Q9NQ31 210 aa4.81□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 TDP1Q9NUW8 608 aa4.81□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 GTSE1Q9NYZ3 720 aa4.81□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 TUBD1Q9UJT1 453 aa4.81□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 SLC8A2Q9UPR5 921 aa4.81□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 ICE1Q9Y2F5 2266 aa4.81□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 LRRK2Q5S007 2527 aa4.81□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 PCDH15Q96QU1 1955 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 ITPR2Q14571 2701 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 WDR27A2RRH5 827 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 MYBPHLA2RUH7 354 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 ENO4A6NNW6 628 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 HEPACAM2A8MVW5 462 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 ZNF263O14978 683 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 SGTAO43765 313 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 PCDHGA12O60330 932 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 NUDT3O95989 172 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 CCNE2O96020 404 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 EGFP01133 1207 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 DARSP14868 501 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 PSMC3P17980 439 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 RDXP35241 583 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 CHN2P52757 468 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 ADKP55263 362 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 RIPPLY3P57055 190 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 HAND2P61296 217 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 CDC42EP1Q00587 391 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 DRP2Q13474 957 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 DGKKQ5KSL6 1271 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 AGAP9Q5VTM2 703 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 ZNF529Q6P280 563 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 RHOUQ7L0Q8 258 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 ERC1Q8IUD2 1116 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 RHOT2Q8IXI1 618 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 DEFB119Q8N690 84 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 KBTBD3Q8NAB2 608 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 PROKR1Q8TCW9 393 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 RLN3Q8WXF3 142 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 PIBF1Q8WXW3 757 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 PIGSQ96S52 555 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 PAAF1Q9BRP4 392 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 TMEM175Q9BSA9 504 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 AZI2Q9H6S1 392 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 TRPV5Q9NQA5 729 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 GDE1Q9NZC3 331 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 FNIP2Q9P278 1114 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 ANAPC4Q9UJX5 808 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 ACTL7AQ9Y615 435 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 TSC2P49815 1807 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 PTPRDP23468 1912 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 TMEM191CA6NGB0 347 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 PLK4O00444 970 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 ZBTB5O15062 677 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 HBP1O60381 514 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 CBFA2T3O75081 653 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 STAM2O75886 525 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 NCR1O76036 304 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 AMY1AP04745 511 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 FPR1P21462 350 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 NR4A1P22736 598 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 PCSK1P29120 753 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 ADSSP30520 456 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 GPC3P51654 580 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 DGKEP52429 567 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 C21orf58P58505 322 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 CTXN1P60606 82 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 CXADRP78310 365 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 RAB39AQ14964 217 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CNN3-206ENST00000487539 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms