RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486621.1

TTC4-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 4, human

TSL 2

Gene TTC4, Length 549 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC4-204	ENST00000486621	ZXDB	P98169	803 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SHB	Q15464	509 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ANO4	Q32M45	955 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	FUT11	Q495W5	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	METTL23	Q86XA0	190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	BIRC7	Q96CA5	298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	OTUB2	Q96DC9	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	DYDC2	Q96IM9	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	RGL1	Q9NZL6	768 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	OBSL1	O75147	1896 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CENPE	Q02224	2701 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	MYH10	P35580	1976 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621		A0A087X1B8	175 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621		K7ERI5	159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TSPAN3	O60637	253 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	FSBP	O95073	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TNFSF15	O95150	251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CLDN1	O95832	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	KRT7	P08729	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ODC1	P11926	461 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	PAX3	P23760	479 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CYP3A7	P24462	503 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	LRPAP1	P30533	357 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ACSL1	P33121	698 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	RXRG	P48443	463 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	EFNA5	P52803	228 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SLC7A9	P82251	487 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	DDR2	Q16832	855 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ISX	Q2M1V0	245 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	DCAF6	Q58WW2	860 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	C14orf80	Q86SX3	495 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	MMP21	Q8N119	569 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	STKLD1	Q8NE28	680 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TBCK	Q8TEA7	893 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SEC14L1	Q92503	715 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SENP8	Q96LD8	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TCHP	Q9BT92	498 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	GDF3	Q9NR23	364 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	DSE	Q9UL01	958 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SPG11	Q96JI7	2443 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621		A0A1W2PPC4	97 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	NPC1	O15118	1278 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TRIM24	O15164	1050 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CYP7B1	O75881	506 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	NOL4	O94818	638 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SLITRK3	O94933	977 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	LYPLA2	O95372	231 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TDP2	O95551	362 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SEMA4F	O95754	770 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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