RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467983.1

ABCB4-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 4, human

TSL 3

Gene ABCB4, Length 414 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCB4-208	ENST00000467983	CCDC188	H7C350	402 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	EPHB6	O15197	1021 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	TP73	O15350	636 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	TJP3	O95049	919 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	ATP6V1G2	O95670	118 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	FTCD	O95954	541 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	FAM163B	P0C2L3	166 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	OR52Z1	P0C646	297 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	PRR35	P0CG20	571 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	LIPA	P38571	399 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	NT5C2	P49902	561 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	GNAQ	P50148	359 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	LRRC63	Q05C16	580 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	STK4	Q13043	487 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	GRM1	Q13255	1194 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	RIPK1	Q13546	671 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	ITIH4	Q14624	930 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	NAA25	Q14CX7	972 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	E2F5	Q15329	346 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	RPS6KA1	Q15418	735 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	ASIC2	Q16515	512 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	ODF2	Q5BJF6	829 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF626	Q68DY1	528 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	NEK8	Q86SG6	692 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	HOOK3	Q86VS8	718 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	CCDC63	Q8NA47	563 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	SCFD2	Q8WU76	684 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	CCT6B	Q92526	530 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	CUL5	Q93034	780 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	PSMD1	Q99460	953 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	NOD2	Q9HC29	1040 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	POLD4	Q9HCU8	107 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	PNPO	Q9NVS9	261 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	NFS1	Q9Y697	457 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	PP2D1	A8MPX8	630 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	PROB1	E7EW31	1015 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983		M0QYG6	137 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	ASAP2	O43150	1006 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	PPIP5K2	O43314	1243 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	TLR5	O60602	858 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	ATP2C2	O75185	946 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	RTN2	O75298	545 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	ONECUT2	O95948	504 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	PAX7	P23759	505 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	AKAP5	P24588	427 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	KLRC1	P26715	233 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	ANXA13	P27216	316 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	TMOD1	P28289	359 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	ICA1	Q05084	483 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	GRIK3	Q13003	919 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	PLS1	Q14651	629 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	PPP1R7	Q15435	360 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC18A3	Q16572	532 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	KRT71	Q3SY84	523 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	MTX3	Q5HYI7	312 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	UNC13D	Q70J99	1090 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	CROCCP2	Q86T23	111 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	TLCD1	Q96CP7	247 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	CALML4	Q96GE6	196 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	PLIN2	Q99541	437 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ABCB4-208	ENST00000467983	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58

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