RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC16A4O15374 487 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ASNA1O43681 348 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM155BO75949 473 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHEK2O96017 543 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACVR2AP27037 513 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPTX2P47972 431 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADAM8P78325 824 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC29A2Q14542 456 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RESP18Q5W5W9 173 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF529Q6P280 563 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLHL17Q6TDP4 642 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 USP37Q86T82 979 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEFB123Q8N688 67 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TOP1MTQ969P6 601 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IFT74Q96LB3 600 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 YME1L1Q96TA2 773 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 APOL6Q9BWW8 343 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IKZF4Q9H2S9 585 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RGS18Q9NS28 235 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TBC1D7Q9P0N9 293 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CAPN11Q9UMQ6 739 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HES2Q9Y543 173 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SQORQ9Y6N5 450 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COL6A3P12111 3177 aa8.99□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TTC3P53804 2025 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COL4A6Q14031 1691 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRSS47A8MTI9 375 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ASAP2O43150 1006 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERLIN2O94905 339 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHA1P01876 353 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRKCBP05771 671 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PFKFB1P16118 471 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CAPN3P20807 821 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NMT1P30419 496 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRT9P35527 623 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NAMPTP43490 491 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RRADP55042 308 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WNT3P56703 355 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TAP1Q03518 808 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GIT2Q14161 759 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 USP10Q14694 798 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZMAT1Q5H9K5 638 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBXN11Q5T124 520 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATL3Q6DD88 541 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIAA0408Q6ZU52 694 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 USP30Q70CQ3 517 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC24A5Q71RS6 500 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ECHDC2Q86YB7 292 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ABI1Q8IZP0 508 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC89Q8N998 374 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FSIP1Q8NA03 581 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARNTL2Q8WYA1 636 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIFAP3Q92845 792 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAD9AQ99638 391 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C17orf80Q9BSJ5 609 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FTHL17Q9BXU8 183 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BLZF1Q9H2G9 400 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 XPR1Q9UBH6 696 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa8.98□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DYTNA2CJ06 578 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC01553A4QN01 128 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TBKBP1A7MCY6 615 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TBCAO75347 108 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPPBP16860 134 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPL13P26373 211 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LIMS1P48059 325 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NDUFA8P51970 172 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DUSP8Q13202 625 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CRB2Q5IJ48 1285 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLLU1OSQ5K130 101 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NT5DC1Q5TFE4 455 aa8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms