RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455020.2

SPDYE2B-202, Transcript of speedy/RINGO cell cycle regulator family member E2B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPDYE2B, Length 1,219 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2B-202ENST00000455020 USP25Q9UHP3 1055 aa20.26■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa20.26■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 NBASA2RRP1 2371 aa20.26■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 H3BM21 787 aa20.25■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 SART1O43290 800 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 GPD2P43304 727 aa20.25■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 OXCT1P55809 520 aa20.25■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 STILQ15468 1287 aa20.25■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 SLC35C1Q96A29 364 aa20.25■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 SGF29Q96ES7 293 aa20.25■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 BOCQ9BWV1 1114 aa20.25■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.25■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.25■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.25■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 E5RJQ4 531 aa20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 CETN3O15182 167 aa20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 RRM1P23921 792 aa20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 SLC5A2P31639 672 aa20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 PKP1Q13835 747 aa20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 TAF5Q15542 800 aa20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 DENND1BQ6P3S1 775 aa20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 TMIEQ8NEW7 156 aa20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 TPCN2Q8NHX9 752 aa20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 CCDC3Q9BQI4 270 aa20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 POPDC2Q9HBU9 364 aa20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 DYRK4Q9NR20 520 aa20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 ANKMY1Q9P2S6 941 aa20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 VANGL2Q9ULK5 521 aa20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa20.24■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa20.23■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 GCATO75600 419 aa20.23■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 HGFP14210 728 aa20.23■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 JUNDP17535 347 aa20.23■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 USP53Q70EK8 1073 aa20.23■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 ATP11CQ8NB49 1132 aa20.23■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 FAM174AQ8TBP5 190 aa20.23■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 RNF34Q969K3 372 aa20.23■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa20.23■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 HDAC8Q9BY41 377 aa20.23■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 SLC17A9Q9BYT1 436 aa20.23■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 TNKS2Q9H2K2 1166 aa20.23■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 FAM204AQ9H8W3 233 aa20.23■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 COX16Q9P0S2 106 aa20.23■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 VPS51Q9UID3 782 aa20.23■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa20.23■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 LRP4O75096 1905 aa20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 TPP1O14773 563 aa20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 PLD2O14939 933 aa20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 PRNPP04156 253 aa20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 ITGB2P05107 769 aa20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 CMA1P23946 247 aa20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 RABIFP47224 123 aa20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 NDUFA8P51970 172 aa20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 AUHQ13825 339 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 SPIDRQ14159 915 aa20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 ARSIQ5FYB1 569 aa20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 C22orf39Q6P5X5 142 aa20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 C14orf80Q86SX3 495 aa20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 PPM1KQ8N3J5 372 aa20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 NT5C1BQ96P26 610 aa20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 IL12RB2Q99665 862 aa20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 LRRC61Q9BV99 259 aa20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 SLC4A5Q9BY07 1137 aa20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 MUC3BQ9H195 1237 aa20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 RABGEF1Q9UJ41 708 aa20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 HS3ST4Q9Y661 456 aa20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.22■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 LEFTY1O75610 366 aa20.21■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 GJB6O95452 261 aa20.21■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 ADRB3P13945 408 aa20.21■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 WT1P19544 449 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 UGT1A5P35504 534 aa20.21■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 SYKP43405 635 aa20.21■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 NEK3P51956 506 aa20.21■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 TLE1Q04724 770 aa20.21■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 C1orf61Q13536 156 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms