RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437322.2

USP27X-AS1-201, Transcript of USP27X antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP27X-AS1, Length 2,175 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCDC33Q8N5R6 958 aa17.55■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SHKBP1Q8TBC3 707 aa17.55■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM210AQ96ND0 272 aa17.55■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TBCBQ99426 244 aa17.55■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MCOLN1Q9GZU1 580 aa17.55■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP17.55■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 H7C0C1 242 aa17.54■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UGT1A9O60656 530 aa17.54■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CNTFP26441 200 aa17.54■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GRIK1P39086 918 aa17.54■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MAGEA3P43357 314 aa17.54■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ATP5OP48047 213 aa17.54■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AQP4P55087 323 aa17.54■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa17.54■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LPCAT4Q643R3 524 aa17.54■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UGT2A3Q6UWM9 527 aa17.54■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UNC5AQ6ZN44 842 aa17.54■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TAS1R1Q7RTX1 841 aa17.54■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC26A7Q8TE54 656 aa17.54■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF778Q96MU6 729 aa17.54■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC2A13Q96QE2 648 aa17.54■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UGT1A7Q9HAW7 530 aa17.54■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UGT1A10Q9HAW8 530 aa17.54■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UGT1A8Q9HAW9 530 aa17.54■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ALPK3Q96L96 1907 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR6C75A6NL08 312 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NOS2P35228 1153 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SULT1E1P49888 294 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CLCN2P51788 898 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CHN2P52757 468 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MAP7Q14244 749 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PDK3Q15120 406 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC25A52Q3SY17 297 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MBLAC2Q68D91 279 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GSDMBQ8TAX9 411 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PGLYRP2Q96PD5 576 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TTPALQ9BTX7 342 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KLC2Q9H0B6 622 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CDH22Q9UJ99 828 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LAMA3Q16787 3333 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EFCAB14O75071 495 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DLG1Q12959 904 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MMRN1Q13201 1228 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MMEL1Q495T6 779 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BOLA3Q53S33 107 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RALGPS1Q5JS13 557 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SYCP2LQ5T4T6 812 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SYPL2Q5VXT5 272 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C4orf22Q6V702 233 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CYS1Q717R9 158 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 STRADAQ7RTN6 431 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BHLHA9Q7RTU4 235 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPATA24Q86W54 205 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SCN4BQ8IWT1 228 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ACMSDQ8TDX5 336 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ITFG2Q969R8 447 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ETNK2Q9NVF9 386 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DNAJC28Q9NX36 388 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PTPRSQ13332 1948 aa17.53■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SIN3BO75182 1162 aa17.52■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LTFP02788 710 aa17.52■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FYNP06241 537 aa17.52■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PEX2P28328 305 aa17.52■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CDH6P55285 790 aa17.52■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ARPP19P56211 112 aa17.52■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa17.52■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OTOP2Q7RTS6 562 aa17.52■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SCAMP5Q8TAC9 235 aa17.52■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGSF21Q96ID5 467 aa17.52■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RNF157Q96PX1 679 aa17.52■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OCEL1Q9H607 264 aa17.52■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa17.52■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IRAK4Q9NWZ3 460 aa17.52■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 STAP1Q9ULZ2 295 aa17.52■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa17.52■□□□□ 0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KCNN4O15554 427 aa17.52■□□□□ 0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ETS2P15036 469 aa17.52■□□□□ 0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CPB1P15086 417 aa17.52■□□□□ 0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC5A3P53794 718 aa17.52■□□□□ 0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MROH9Q5TGP6 573 aa17.52■□□□□ 0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PM20D1Q6GTS8 502 aa17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms