RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF385DQ9H6B1 395 aa18.62■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa18.62■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 EPS15L1Q9UBC2 864 aa18.62■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 FZD10Q9ULW2 581 aa18.62■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC22A2O15244 555 aa18.62■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 GLUD2P49448 558 aa18.62■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 SNX16P57768 344 aa18.62■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 NRF1Q16656 503 aa18.62■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF792Q3KQV3 632 aa18.62■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 LPCAT2Q7L5N7 544 aa18.62■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF139Q8WU17 664 aa18.62■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 MFSD3Q96ES6 412 aa18.62■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 BIRC8Q96P09 236 aa18.62■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 NMRAL1Q9HBL8 299 aa18.62■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP18.62■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa18.62■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAM28Q9UKQ2 775 aa18.62■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 TSPAN1O60635 241 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 C2P06681 752 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM163BP0C2L3 166 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 BST2Q10589 180 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 TTLL4Q14679 1199 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 IL23RQ5VWK5 629 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM198Q66K66 360 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 TAPT1Q6NXT6 567 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 CLEC14AQ86T13 490 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 EME1Q96AY2 570 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM149B1Q96BN6 582 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 ERAP1Q9NZ08 941 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 BLOC1S6Q9UL45 172 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 H0YJX3 145 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA8TH3BQL2 631 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 TK2O00142 265 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 HDAC3O15379 428 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 H6PDO95479 791 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 SULT1E1P49888 294 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 ART3Q13508 389 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 GLRA4Q5JXX5 417 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 SEL1L3Q68CR1 1132 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 URGCPQ8TCY9 931 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF597Q96LX8 424 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 PTPN18Q99952 460 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 NUF2Q9BZD4 464 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 COQ10BQ9H8M1 238 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa18.61■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGEF37A1IGU5 675 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 LMO2P25791 158 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGAP1Q07960 439 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 DPYSQ14117 519 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 HERC3Q15034 1050 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 CARM1Q86X55 608 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 CROCCP3Q8IVE0 287 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 DEFB106AQ8N104 65 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAAF3Q8N9W5 541 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 MARK4Q96L34 752 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC40Q9H9A6 602 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 EFCAB1Q9HAE3 211 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 FAIMQ9NVQ4 179 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 TBCCD1Q9NVR7 557 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 VANGL2Q9ULK5 521 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 RAP2CQ9Y3L5 183 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 ASB14A6NK59 587 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 H3BNH8 94 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 GRID2O43424 1007 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 RPL14P50914 215 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 DCAF6Q58WW2 860 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 STRADAQ7RTN6 431 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD52Q8NB46 1076 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM156AQ8NDB6 213 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP6V1E2Q96A05 226 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 RRAGCQ9HB90 399 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 OXSMQ9NWU1 459 aa18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 VAPBO95292 243 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 CELF2O95319 508 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 MPOP05164 745 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 JUNP05412 331 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 NELFEP18615 380 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 SAT1P21673 171 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 ADCYAP1R1P41586 468 aa18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms