RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411292.1

SNORD71-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 71, humanhuman

BASIC

Gene SNORD71, Length 86 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD71-201ENST00000411292 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 A0A0U1RQJ8 604 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 A0A1W2PP11 408 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 FEZF1A0PJY2 475 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 CCDC189A1A4V9 331 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 WDR91A4D1P6 747 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 CTAGE9A4FU28 777 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 TBC1D3BA6NDS4 549 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 TMEM247A6NEH6 219 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 HMX3A6NHT5 357 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 RRN3P2A6NIE6 340 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 KCNU1A8MYU2 1149 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 TBC1D3LB9A6J9 549 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 J3KR12 359 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 RHODO00212 210 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 DSCR3O14972 297 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 PER2O15055 1255 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 KLK10O43240 276 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 HBP1O60381 514 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 PAGE4O60829 102 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 USP12O75317 370 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 TULP3O75386 442 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 GCATO75600 419 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 WISP2O76076 250 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 NDUFB8O95169 186 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 OR2C1O95371 312 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 TBX18O95935 607 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 SCGB1D1O95968 90 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 SERPINC1P01008 464 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 URODP06132 367 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 MMP3P08254 477 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 CD63P08962 238 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 TBC1D3HP0C7X1 549 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 CTAGE8P0CG41 777 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 SRGAP2BP0DMP2 458 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 PSG1P11464 419 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 LAMP2P13473 410 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 CYP4B1P13584 511 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 TNNT1P13805 278 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 ZNF12P17014 697 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 CHRNB2P17787 502 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 CD53P19397 219 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 CAPN3P20807 821 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 MAOAP21397 527 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 MYF6P23409 242 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 ABCD3P28288 659 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 MPGP29372 298 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 PTGER1P34995 402 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 BSGP35613 385 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 THPOP40225 353 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 RGS2P41220 211 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 GPD2P43304 727 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 FASLGP48023 281 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 PPP3CCP48454 512 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 PDLIM4P50479 330 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 CLCNKBP51801 687 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 RPS6KA3P51812 740 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 PGGT1BP53609 377 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 OAZ1P54368 228 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 PDE1AP54750 535 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 P2RX3P56373 397 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 CLDN2P57739 230 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 ZP1P60852 638 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 ABATP80404 500 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 GALNT2Q10471 571 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 ST3GAL1Q11201 340 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 TRAF3Q13114 568 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 GPS2Q13227 327 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 MTA1Q13330 715 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 BFSP2Q13515 415 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 ERV3-1Q14264 604 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 IL13RA2Q14627 380 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 ANKRD1Q15327 319 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 TAF5Q15542 800 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 SLC18A3Q16572 532 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 ADCK5Q3MIX3 580 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 ESCO2Q56NI9 601 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 SGO1Q5FBB7 561 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 ENTPD8Q5MY95 495 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD71-201ENST00000411292 Q5PR19 223 aa0.5□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms