RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 KLC2Q9H0B6 622 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 SETD4Q9NVD3 440 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 UVRAGQ9P2Y5 699 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 FTSJ1Q9UET6 329 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 CROTQ9UKG9 612 aa6.87□□□□□ -1.31
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CCL20-202ENST00000409189 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 M0QZ92 97 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 KRIT1O00522 736 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 XPOTO43592 962 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
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CCL20-202ENST00000409189 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 TACR2P21452 398 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
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CCL20-202ENST00000409189 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 ZNF528Q3MIS6 628 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 CCDC181Q5TID7 509 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 SPATC1Q76KD6 591 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 RSPH3Q86UC2 560 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 PALB2Q86YC2 1186 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 THNSL1Q8IYQ7 743 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 PJA1Q8NG27 643 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 ZNF653Q96CK0 615 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 ZBTB10Q96DT7 871 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
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CCL20-202ENST00000409189 CYP3A43Q9HB55 503 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 DLL4Q9NR61 685 aa6.86□□□□□ -1.31
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CCL20-202ENST00000409189 MMEP08473 750 aa6.85□□□□□ -1.31
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CCL20-202ENST00000409189 ABCB4P21439 1286 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 PAFAH1B1P43034 410 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 GSCP56915 257 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
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CCL20-202ENST00000409189 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.85□□□□□ -1.31
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CCL20-202ENST00000409189 LRRC52Q8N7C0 313 aa6.85□□□□□ -1.31
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CCL20-202ENST00000409189 ARHGEF26Q96DR7 871 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 PBKQ96KB5 322 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 ZNF560Q96MR9 790 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 ACAP3Q96P50 834 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
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