RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321358.11

YBX1-201, Transcript of Y-box binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene YBX1, Length 1,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1-201ENST00000321358 ACTN2P35609 894 aa21.54■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 ZNF234Q14588 700 aa21.54■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 CCDC105Q8IYK2 499 aa21.54■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 SH2D3CQ8N5H7 860 aa21.54■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 ATL2Q8NHH9 583 aa21.54■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 VAT1Q99536 393 aa21.54■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 CEP44Q9C0F1 390 aa21.54■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 LMAN1LQ9HAT1 526 aa21.54■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa21.54■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 SGK1O00141 431 aa21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 TMCC1O94876 653 aa21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 ITGAVP06756 1048 aa21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 SRCP12931 536 aa21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 TARSP26639 723 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 CHRNA3P32297 505 aa21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 MMP13P45452 471 aa21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 DLG2Q15700 870 aa21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 CYP1B1Q16678 543 aa21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 PTPRNQ16849 979 aa21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 EMC10Q5UCC4 262 aa21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 TRIM67Q6ZTA4 783 aa21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 RUNDC3BQ96NL0 473 aa21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 TMEM121Q9BTD3 319 aa21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 OSBPL6Q9BZF3 934 aa21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.043e-9■■■■■ 26.9
YBX1-201ENST00000321358 SUN2Q9UH99 717 aa21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 AMACRQ9UHK6 382 aa21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 K7ERQ8 282 aa21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 ATP9BO43861 1147 aa21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 RNF40O75150 1001 aa21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 CHRNB1P11230 501 aa21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 NTSR1P30989 418 aa21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 FNTAP49354 379 aa21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 RHOAP61586 193 aa21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 SLC10A7Q0GE19 358 aa21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 CCDC89Q8N998 374 aa21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 FAM71DQ8N9W8 422 aa21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 SPATA4Q8NEY3 305 aa21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 FLCNQ8NFG4 579 aa21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 GRK7Q8WTQ7 553 aa21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 MAML1Q92585 1016 aa21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 MRGPRX3Q96LB0 322 aa21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 FOXQ1Q9C009 403 aa21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 C10orf88Q9H8K7 445 aa21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 TRHDEQ9UKU6 1024 aa21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 TTLL3Q9Y4R7 772 aa21.52■■□□□ 1.04
YBX1-201ENST00000321358 RNF103O00237 685 aa21.51■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 PEX11BO96011 259 aa21.51■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 COILP38432 576 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 ITKQ08881 620 aa21.51■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 OASLQ15646 514 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 TEX44Q53QW1 395 aa21.51■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 USP33Q8TEY7 942 aa21.51■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 PSKH2Q96QS6 385 aa21.51■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa21.51■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 SIT1Q9Y3P8 196 aa21.51■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 ACTL7AQ9Y615 435 aa21.51■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 STON1Q9Y6Q2 735 aa21.51■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 ATG13O75143 517 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 CD160O95971 181 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 IFNB1P01574 187 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 EPHX1P07099 455 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 VAV1P15498 845 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 KCNJ1P48048 391 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 STARD3Q14849 445 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 CYTH1Q15438 398 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 C22orf39Q6P5X5 142 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 PID1Q7Z2X4 250 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 KLHL7Q8IXQ5 586 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 TEX26Q8N6G2 289 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 CEP112Q8N8E3 955 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 PJA1Q8NG27 643 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 AGAP3Q96P47 875 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 USP29Q9HBJ7 922 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 NT5MQ9NPB1 228 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 COL4A3Q01955 1670 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 TTC34A8MYJ7 566 aa21.5■■□□□ 1.03
YBX1-201ENST00000321358 BNIP3LO60238 219 aa21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms