RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 CHRNA3P32297 505 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 NOP2P46087 812 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 NEK3P51956 506 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 CLDN2P57739 230 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 SEPT6Q14141 434 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 ELOCQ15369 112 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 E2F4Q16254 413 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF542PQ5EBM4 170 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 PRRT3Q5FWE3 981 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 FSCBQ5H9T9 825 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 FAXCQ5TGI0 409 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 RAP1GAP2Q684P5 730 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 LVRNQ6Q4G3 990 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 GCNT7Q6ZNI0 430 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM186BQ8IYM0 893 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 APCDD1Q8J025 514 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 ARL10Q8N8L6 244 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP11CQ8NB49 1132 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 DENND6BQ8NEG7 585 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 ATL2Q8NHH9 583 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 FRS2Q8WU20 508 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 HDAC8Q9BY41 377 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 MUC3BQ9H195 1237 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 EPN3Q9H201 632 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 FZD3Q9NPG1 666 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB20Q9NX57 234 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 U3KQA8 63 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 ATMQ13315 3056 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 BLACEA4D250 179 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 D6RAR5 112 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPAN6O43657 245 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 ACADSBP45954 432 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 NASPP49321 788 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 ADKP55263 362 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 POLE2P56282 527 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 YPEL5P62699 121 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 FZD2Q14332 565 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 TGIF1Q15583 401 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 NFIL3Q16649 462 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 PERM1Q5SV97 790 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 NADSYN1Q6IA69 706 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6B2Q6IFH4 312 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZVU0 165 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 BEND5Q7L4P6 421 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 BHLHA9Q7RTU4 235 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 GKN2Q86XP6 184 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 SH2D3CQ8N5H7 860 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 IL22RA1Q8N6P7 574 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 UBA3Q8TBC4 463 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB7BQ96AH8 199 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 EFHD1Q9BUP0 239 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 BLZF1Q9H2G9 400 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM51Q9NW97 253 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 GULP1Q9UBP9 304 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 IL36AQ9UHA7 158 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 SARDHQ9UL12 918 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 LOXL2Q9Y4K0 774 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 CLEC18AA5D8T8 446 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNU1A8MYU2 1149 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 M0QYV0 167 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 AP1G1O43747 822 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 NOBOXO60393 691 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 VPS4BO75351 444 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 CLDN11O75508 207 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 AGFG2O95081 481 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 PAEPP09466 180 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM49P0CI25 452 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM49CP0CI26 452 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 EPB41P11171 864 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 VAV1P15498 845 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 HTR1BP28222 390 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 CCR1P32246 355 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 MAPK10P53779 464 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 TAS2R38P59533 333 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 MC1RQ01726 317 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 PPARDQ03181 441 aa8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms