RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219302.7

NME3-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME3, Length 1,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-201ENST00000219302 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa16.12■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 IFT43Q96FT9 208 aa16.12■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 BMFQ96LC9 184 aa16.12■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 C1orf74Q96LT6 269 aa16.12■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 SIX2Q9NPC8 291 aa16.12■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 GPR27Q9NS67 375 aa16.12■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 RRN3Q9NYV6 651 aa16.12■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 U3KQA8 63 aa16.12■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 TRPM6Q9BX84 2022 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 FFAR2O15552 330 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 MYF5P13349 255 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 SNX16P57768 344 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 CCDC173Q0VFZ6 552 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 FGL2Q14314 439 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 EXOC3L4Q17RC7 722 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 SEL1L3Q68CR1 1132 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 LINGO4Q6UY18 593 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 Q6ZSR6 202 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 TMC6Q7Z403 805 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 SLC47A2Q86VL8 602 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 FAM181AQ8N9Y4 354 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 DCAF4L2Q8NA75 395 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 HIC2Q96JB3 615 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 APOLD1Q96LR9 279 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 CCDC114Q96M63 670 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 CALN1Q9BXU9 219 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 NLGN3Q9NZ94 848 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 MPP6Q9NZW5 540 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 ZNF212Q9UDV6 495 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 WASF2Q9Y6W5 498 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 CFAP46Q8IYW2 2715 aa16.11■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 SCAMP1O15126 338 aa16.1■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 LEFTY1O75610 366 aa16.1■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 ZMPSTE24O75844 475 aa16.1■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 DXOO77932 396 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 PCDH8O95206 1070 aa16.1■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 GP1BAP07359 652 aa16.1■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 KRT9P35527 623 aa16.1■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 HS1BP3Q53T59 392 aa16.1■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 ZNF542PQ5EBM4 170 aa16.1■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa16.1■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 C22orf39Q6P5X5 142 aa16.1■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 FAM174AQ8TBP5 190 aa16.1■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 TNKS2Q9H2K2 1166 aa16.1■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 PLCB1Q9NQ66 1216 aa16.1■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 DYRK4Q9NR20 520 aa16.1■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 IL36AQ9UHA7 158 aa16.1■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 RWDD2AQ9UIY3 292 aa16.1■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 ATMQ13315 3056 aa16.09■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 POM121BA6NF01 834 aa16.09■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 K7ESM1 405 aa16.09■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 RAD51BO15315 384 aa16.09■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 F9P00740 461 aa16.09■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 MPOP05164 745 aa16.09■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 GABRB2P47870 512 aa16.09■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 FZD2Q14332 565 aa16.09■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 BNIPLQ7Z465 357 aa16.09■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa16.09■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 CREBRFQ8IUR6 639 aa16.09■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 FAM71AQ8IYT1 594 aa16.09■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 ZNF843Q8N446 348 aa16.09■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 OR7D4Q8NG98 312 aa16.09■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 TBCBQ99426 244 aa16.09■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 SLC17A9Q9BYT1 436 aa16.09■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 DNAJC12Q9UKB3 198 aa16.09■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 FADS3Q9Y5Q0 445 aa16.09■□□□□ 0.17
NME3-201ENST00000219302 ILVBLA1L0T0 632 aa16.08■□□□□ 0.16
NME3-201ENST00000219302 NEMP2A6NFY4 417 aa16.08■□□□□ 0.16
NME3-201ENST00000219302 A6NNZ2 444 aa16.08■□□□□ 0.16
NME3-201ENST00000219302 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NME3-201ENST00000219302 ENDOD1O94919 500 aa16.08■□□□□ 0.16
NME3-201ENST00000219302 CD160O95971 181 aa16.08■□□□□ 0.16
NME3-201ENST00000219302 CSF2P04141 144 aa16.08■□□□□ 0.16
NME3-201ENST00000219302 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NME3-201ENST00000219302 ALPPL2P10696 532 aa16.08■□□□□ 0.16
NME3-201ENST00000219302 OR1E1P30953 314 aa16.08■□□□□ 0.16
NME3-201ENST00000219302 L1CAMP32004 1257 aa16.08■□□□□ 0.16
NME3-201ENST00000219302 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NME3-201ENST00000219302 SCNN1AP37088 669 aa16.08■□□□□ 0.16
NME3-201ENST00000219302 LSSP48449 732 aa16.08■□□□□ 0.16
NME3-201ENST00000219302 SULT1E1P49888 294 aa16.08■□□□□ 0.16
NME3-201ENST00000219302 NEK3P51956 506 aa16.08■□□□□ 0.16
NME3-201ENST00000219302 RPS21P63220 83 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms