RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000068056.11

Ddx39b-201, Transcript of Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ddx39b, Length 1,739 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ccdc94Q9D6J3 314 aa18.51■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ddx24Q9ESV0 857 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Caln1Q9JJG7 219 aa18.51■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Bag6Q9Z1R2 1154 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm10800D3Z496 220 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm6205E9PZS2 359 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Colca2F8VPY8 239 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm3159K7N760 267 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nek2O35942 443 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Htr2cP34968 459 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ndst2P52850 883 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 HccsP53702 272 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ncf4P97369 339 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Znf367Q0VDT2 340 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Prss53Q571E5 552 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sh3gl3Q62421 347 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr1057Q7TR75 315 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ctdp1Q7TSG2 960 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 TdrkhQ80VL1 560 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nop53Q8BK35 484 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cmtr2Q8BWQ4 767 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm6367Q8C6L9 287 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 C1raQ8CG16 707 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ly6g6eQ8K1T6 166 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Stap2Q8R0L1 411 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Eif3cQ8R1B4 911 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tasp1Q8R1G1 420 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 RhoqQ8R527 205 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cuedc2Q9CXX9 284 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Senp8Q9D2Z4 221 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fam217aQ9D9W6 419 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tlr9Q9EQU3 1032 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rcan3Q9JKK0 239 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ankrd2Q9WV06 328 aa18.5■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Auts2A0A087WPF7 1261 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 H2-M9O19442 342 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Pou2f3P31362 431 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gdf5P43027 495 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Il12bP43432 335 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Smpdl3bP58242 456 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 9130409I23RikQ3TS87 320 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 StilQ60988 1262 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nt5eQ61503 576 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Krt32Q62168 407 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tpp2Q64514 1262 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fcrl5Q68SN8 596 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Slc7a4Q8BLQ7 635 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fra10ac1Q8BP78 315 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Stard13Q923Q2 1113 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Thg1lQ9CY52 298 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Q9D5Y0 588 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Slc25a19Q9DAM5 318 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Slc23a2Q9EPR4 648 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ccdc86Q9JJ89 426 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sars2Q9JJL8 518 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Akip1Q9JJR5 212 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 CalcrlQ9R1W5 463 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 F6Y6L6 278 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Glb1P23780 647 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cdo1P60334 200 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Csrp2P97314 193 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Taar8aQ5QD07 344 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Trim21Q62191 470 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Lrrc27Q80YS5 523 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rnf187Q8BFX1 236 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 PigtQ8BXQ2 582 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Dync1li1Q8R1Q8 523 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Pcdhb6Q91XZ4 772 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Usp11Q99K46 921 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Mta2Q9R190 668 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ggt5Q9Z2A9 573 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Notch4P31695 1964 aa18.49■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Dock6Q8VDR9 2080 aa18.48■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 NuggcD3YWJ0 796 aa18.48■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Scgb2b19J3QM75 112 aa18.48■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 EdaO54693 391 aa18.48■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 PorP37040 678 aa18.48■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Vps45P97390 570 aa18.48■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nhej1Q3KNJ2 295 aa18.48■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 D17Wsu92eQ3TT38 291 aa18.48■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm11492Q5ND19 536 aa18.48■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Lamb3Q61087 1168 aa18.48■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Itga7Q61738 1179 aa18.48■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Znf185Q62394 352 aa18.48■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 MdficQ8BX65 247 aa18.48■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Slitrk6Q8C110 840 aa18.48■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gbp5Q8CFB4 590 aa18.48■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Il17cQ8K4C5 194 aa18.48■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Pdlim2Q8R1G6 349 aa18.48■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Epsti1Q8VDI1 314 aa18.48■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rpn2Q9DBG6 631 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rgs3Q9DC04 966 aa18.48■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ca7Q9ERQ8 264 aa18.48■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Dnase2bQ9QY48 354 aa18.48■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gbp2Q9Z0E6 589 aa18.48■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Slc35g2D3YVE8 412 aa18.47■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Glyatl3E9Q5L8 290 aa18.47■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Vmn2r14E9Q759 848 aa18.47■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 BC024978J3QPC3 361 aa18.47■□□□□ 0.55
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Igkv7-33P01632 114 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.6 ms