RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000035812.13

Ttl-201, Transcript of Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttl, Length 4,567 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttl-201ENSMUST00000035812 Tada2bD3Z4Z0 420 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
Ttl-201ENSMUST00000035812 Il1rl1P14719 567 aa16.46■□□□□ 0.23
Ttl-201ENSMUST00000035812 Il1rnP25085 178 aa16.46■□□□□ 0.23
Ttl-201ENSMUST00000035812 Nudt1P53368 156 aa16.46■□□□□ 0.23
Ttl-201ENSMUST00000035812 Tnks2Q3UES3 1166 aa16.46■□□□□ 0.23
Ttl-201ENSMUST00000035812 Serpinb6dQ3UWK8 375 aa16.46■□□□□ 0.23
Ttl-201ENSMUST00000035812 HadhaQ8BMS1 763 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
Ttl-201ENSMUST00000035812 Dus1lQ8C2P3 475 aa16.46■□□□□ 0.23
Ttl-201ENSMUST00000035812 Sit1Q8C503 180 aa16.46■□□□□ 0.23
Ttl-201ENSMUST00000035812 PygbQ8CI94 843 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
Ttl-201ENSMUST00000035812 Mapk8Q91Y86 384 aa16.46■□□□□ 0.23
Ttl-201ENSMUST00000035812 Syde1Q9DBZ9 737 aa16.46■□□□□ 0.23
Ttl-201ENSMUST00000035812 Nif3l1Q9EQ80 376 aa16.46■□□□□ 0.23
Ttl-201ENSMUST00000035812 Foxe3Q9QY14 288 aa16.46■□□□□ 0.23
Ttl-201ENSMUST00000035812 Morf4l2Q9R0Q4 288 aa16.46■□□□□ 0.23
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gm4756A0A140LIS8 335 aa16.46■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gna12P27600 379 aa16.46■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Cul4aQ3TCH7 759 aa16.46■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 HecaQ3V1N5 544 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Kiaa0895Q7TQE7 519 aa16.46■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 CenpuQ8C4M7 410 aa16.46■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Nipsnap3bQ9CQE1 247 aa16.46■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Vwa7Q9JHA8 891 aa16.46■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Col2a1P28481 1487 aa16.46■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gm3854A0A1B0GSS6 495 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gm14781A2A9Q9 366 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Olfr742A2RTP5 311 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 RerglB2RVE2 204 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gm9857F7CXR1 130 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Banf1O54962 89 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Mageb5Q14AN0 366 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Prss36Q5K2P8 849 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Il17reQ8BH06 637 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Lyve1Q8BHC0 318 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Palm2Q8BR92 376 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Sash3Q8K352 380 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ccdc182Q9D9C6 152 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Pgam1Q9DBJ1 254 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Spag6Q9JLI7 507 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Rsrc2A2RTL5 376 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gm28043E0CXC2 719 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Kpna3O35344 521 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 CartptP56388 129 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Rrp36Q3UFY0 244 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 ItgadQ3V0T4 1168 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Mtmr12Q80TA6 747 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Fam109aQ8BH49 266 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Acad10Q8K370 1069 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 MiosQ8VE19 875 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Cpt1bQ924X2 772 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Mrpl1Q99N96 336 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 PirQ9D711 290 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Dnajb2Q9QYI5 324 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ppp2r3dQ9Z176 491 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Htatip2Q9Z2G9 242 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Igkv18-36A0A075B5M9 114 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gm11239E9Q5Z9 360 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gm11237F2Z3W5 360 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gm11238F2Z478 360 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Cyp8b1O88962 500 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 SpnP15702 395 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Cdk16Q04735 496 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gm428Q3UTE2 360 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Snx31Q6P8Y7 439 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 CtifQ6PEE2 600 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Creb3l2Q8BH52 521 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Nup54Q8BTS4 510 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Hars2Q99KK9 505 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Trpd52l3Q9CQ14 231 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Nudt8Q9CR24 210 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 DpysQ9EQF5 519 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Znf354bQ9QXT9 601 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Coro1bQ9WUM3 484 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 PrebQ9WUQ2 417 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Lilra5D3Z7A9 295 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Pik3cdO35904 1043 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Slc7a2P18581 657 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Hipk4Q3V016 616 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 RhoqQ8R527 205 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Eif3hQ91WK2 352 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Homer3Q99JP6 356 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Fads3Q9JJE7 449 aa16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Rfc2Q9WUK4 349 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa16.44■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Vmn2r4K7N784 913 aa16.44■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Top3aO70157 1003 aa16.44■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Slfn4Q3UV66 602 aa16.44■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 VwdeQ6DFV8 926 aa16.44■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ube2q2Q8K2Z8 378 aa16.44■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Nae1Q8VBW6 534 aa16.44■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Rnf146Q9CZW6 359 aa16.44■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Oma1Q9D8H7 521 aa16.44■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Sppl2cA2A6C4 690 aa16.44■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 PnmtP40935 295 aa16.44■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 E330034G19RikQ3UWX6 351 aa16.44■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Fbxw11Q5SRY7 542 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Fam46cQ5SSF7 391 aa16.44■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Mrgpra2Q91WW4 305 aa16.44■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 Glra3Q91XP5 464 aa16.44■□□□□ 0.22
Ttl-201ENSMUST00000035812 SardhQ99LB7 919 aa16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.2 ms