RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rnf219Q8K2Y0 722 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sh3kbp1Q8R550 709 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rprd1aQ8VDS4 312 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Serpina3nQ91WP6 418 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pip4k2cQ91XU3 421 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ska1Q9CPV1 254 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tbc1d15Q9CXF4 671 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pld1Q9Z280 1074 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm29554A0A087WNW4 188 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr671A0A1B0GSN5 317 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cyp4a12bA2A974 508 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ptchd4B9EKX1 904 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pdzd7E9Q9W7 1021 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rfx2P48379 717 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PolgP54099 1218 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fbxl5Q8C2S5 690 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Amer2Q8CCJ4 672 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfp263Q8CF60 680 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cyp2d26Q8CIM7 500 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Epm2aip1Q8VEH5 606 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pofut2Q8VHI3 429 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ak5Q920P5 562 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 MtrexQ9CZU3 1040 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc15a2Q9ES07 729 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cog8Q9JJA2 640 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trip11E9Q512 1976 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm3173A6NAS3 172 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rfx8D3YU81 596 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm3020E9Q3J7 150 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 C130060K24RikG3UWA8 416 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm2897K7N6T7 172 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cdc6O89033 562 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Eno2P17183 434 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 ZfaP23607 742 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kcnj2P35561 428 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Myl2P51667 166 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 ThraP63058 492 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prdx5P99029 210 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Col6a1Q04857 1025 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Col9a2Q07643 688 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Bcap31Q61335 245 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dmc1Q61880 340 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Disc1Q811T9 852 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gpr180Q8BPS4 441 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm3411Q8C7R2 150 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Agbl3Q8CDP0 1006 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cog3Q8CI04 820 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Krtcap3Q8K177 240 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Unc93b1Q8VCW4 598 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tex46Q9CPU3 165 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ccdc103Q9D9P2 237 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PgdQ9DCD0 483 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Chst7Q9EP78 484 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr703Q9EPF5 319 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cpb2Q9JHH6 422 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PignQ9R1S3 931 aa9.09□□□□□ -0.95
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm36028A0A0U1RPM1 299 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm21964A0A1W2P7S4 437 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam71aB7XG49 585 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Xpnpep3B7ZMP1 506 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trim12cD3Z3L3 497 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr220E9Q050 325 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Bub1O08901 1058 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Drd4P51436 387 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 EsrrgP62509 458 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tuba4aP68368 448 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Serac1Q3U213 654 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Eml4Q3UMY5 988 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Znf280cQ6P3Y5 742 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Galnt10Q6P9S7 603 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Q6PAC4 1279 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trim62Q80V85 475 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Wscd1Q80XH4 572 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rhpn2Q8BWR8 686 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 ClmnQ8C5W0 1052 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Asb2Q8K0L0 634 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Wdr11Q8K1X1 1223 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ccdc58Q8R3Q6 144 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pcdha9Q91Y11 979 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NgrnQ99KS2 293 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PrccQ9EQC8 491 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trim39Q9ESN2 488 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Clcn2Q9R0A1 908 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tagln3Q9R1Q8 199 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 LipaQ9Z0M5 397 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fkbp9Q9Z247 570 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kmt2eQ3UG20 1868 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tcp10cE9Q046 482 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vmn2r100E9QAZ9 850 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 E030030I06RikJ3QML9 246 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prl6a1O35257 230 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Oaz1P54369 227 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Armcx5Q3UZB0 606 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Srbd1Q497V5 1015 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Grid1Q61627 1009 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr412Q7TRW7 312 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Q80WR5 230 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kbtbd3Q8BHI4 607 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ticam2Q8BJQ4 232 aa9.08□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Arhgap25Q8BYW1 648 aa9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.4 ms