RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	SLC2A3	P11169	496 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	MYF5	P13349	255 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	C6	P13671	934 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	AKT2	P31751	481 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	IRAK1	P51617	712 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	SKOR1	P84550	965 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	GCNT1	Q02742	428 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	LRRC63	Q05C16	580 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	PNOC	Q13519	176 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	LY6D	Q14210	128 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	MEA1	Q16626	185 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	ISX	Q2M1V0	245 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	RRAGA	Q7L523	313 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	HSCB	Q8IWL3	235 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	NOX5	Q96PH1	765 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	MED15	Q96RN5	788 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	THSD1	Q9NS62	852 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	RMND1	Q9NWS8	449 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	ATM	Q13315	3056 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169		E5RJQ4	531 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169		K7ESM1	405 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	P4HA2	O15460	535 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	BNIP3L	O60238	219 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	CHRNA3	P32297	505 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	CLDN2	P57739	230 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	CENPC	Q03188	943 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	TMIE	Q8NEW7	156 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	ARRDC3	Q96B67	414 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	MED8	Q96G25	268 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	GSDMA	Q96QA5	445 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	CALN1	Q9BXU9	219 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	ABCG4	Q9H172	646 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	CLMP	Q9H6B4	373 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	FZD3	Q9NPG1	666 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	GPR27	Q9NS67	375 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	VPS28	Q9UK41	221 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	PTPN13	Q12923	2485 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169		A6NNZ2	444 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169		K7ENP7	123 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	RNF103	O00237	685 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	MT-CO1	P00395	513 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	SRC	P12931	536 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	TGM2	P21980	687 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	CCR1	P32246	355 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	CDK17	Q00537	523 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	CETN1	Q12798	172 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	MTA1	Q13330	715 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	TAF5	Q15542	800 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	C5orf22	Q49AR2	442 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169		Q6ZSR6	202 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	DEFB106A	Q8N104	65 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	IFI44	Q8TCB0	444 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	MAPK15	Q8TD08	544 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	BMF	Q96LC9	184 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	CEP63	Q96MT8	703 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	PSMB7	Q99436	277 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	DDIT4	Q9NX09	232 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-238	ENST00000568169	SATB2	Q9UPW6	733 aa		11.66	□□□□□ -0.54

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