RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 H3BQF6 201 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 AGPSO00116 658 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 PRPSAP2O60256 369 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 OPA1O60313 960 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 PPFIA2O75334 1257 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 FBXO21O94952 628 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM200BP0CF97 657 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 ITIH2P19823 946 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF33AQ06730 810 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 GAB4Q2WGN9 574 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 CFAP58Q5T655 872 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM171BQ6P995 826 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 ZDHHC24Q6UX98 284 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 LRIG3Q6UXM1 1119 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 CLEC20AQ6ZU45 233 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 GLRX5Q86SX6 157 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 BBOF1Q8ND07 529 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 A0A087WV48 116 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 PIK3R2O00459 728 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 MDM4O15151 490 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 SYF2O95926 243 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 KRT10P13645 584 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 TIE1P35590 1138 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 GPR15P49685 360 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 SNX1Q13596 522 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 STRADAQ7RTN6 431 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 TMC3Q7Z5M5 1100 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 SLCO6A1Q86UG4 719 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM35AQ86V20 835 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 MAP7D3Q8IWC1 876 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 DEFB119Q8N690 84 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC89Q8N998 374 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 KCTD6Q8NC69 237 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 STKLD1Q8NE28 680 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 MYRFLQ96LU7 910 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 PEBP4Q96S96 227 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 MED10Q9BTT4 135 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIM31Q9BZY9 425 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 TSPYL1Q9H0U9 437 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 KLHL11Q9NVR0 708 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDSP2-204ENST00000548823 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 NDC80O14777 642 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 DAB1O75553 588 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 C1QL1O75973 258 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 ITGAVP06756 1048 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 IVDP26440 423 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 ADCY2Q08462 1091 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 LLGL1Q15334 1064 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 TAF5Q15542 800 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 RAB41Q5JT25 222 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 SCML4Q8N228 414 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM172AQ8WUF8 416 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC39A7Q92504 469 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 SNF8Q96H20 258 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 CFAP57Q96MR6 1250 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 LRRC4Q9HBW1 653 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 PCSK1NQ9UHG2 260 aa20.51■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 A0A0A0MRY4 1105 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 KALRNO60229 2985 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 GRAP2O75791 330 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 LCP1P13796 627 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 GGCXP38435 758 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 MATKP42679 507 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 PLTPP55058 493 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 CALCOCO2Q13137 446 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 TFDP2Q14188 446 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 OASLQ15646 514 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 KAZNQ674X7 775 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 FBXO25Q8TCJ0 367 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 SMARCD1Q96GM5 515 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 CRELD1Q96HD1 420 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 PCED1BQ96HM7 432 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 RUFY1Q96T51 708 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 PKMYT1Q99640 499 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 CNGB3Q9NQW8 809 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 HELZP42694 1942 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 NAV2Q8IVL1 2488 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.7 ms