RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	CCR5	P51681	352 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	TAS2R50	P59544	299 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	MPP1	Q00013	466 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	TLE3	Q04726	772 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	TEF	Q10587	303 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	GPR68	Q15743	365 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	CNGA3	Q16281	694 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	BBS12	Q6ZW61	710 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	GPC2	Q8N158	579 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	KCNJ9	Q92806	393 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	ABHD8	Q96I13	439 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	CLPB	Q9H078	707 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	PREB	Q9HCU5	417 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	GCAT	O75600	419 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	TJP3	O95049	919 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	CYP21A2	P08686	494 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	TACR2	P21452	398 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	MAP2K2	P36507	400 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	CASP2	P42575	452 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	PAFAH1B1	P43034	410 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	VPS41	P49754	854 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	RGS19	P49795	217 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	LBX1	P52954	281 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	GPC5	P78333	572 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	TAP1	Q03518	808 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	NFIL3	Q16649	462 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	VRK3	Q8IV63	474 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	ST8SIA4	Q92187	359 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC17	Q96LX7	622 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	NYX	Q9GZU5	481 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	NUP98	P52948	1817 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	LTBP1	Q14766	1721 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	GRM8	O00222	908 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	FZD7	O75084	574 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF202	O95125	648 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	CYP3A4	P08684	503 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	CSF1	P09603	554 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MDM2-223	ENST00000536089	C6	P13671	934 aa		4.47	□□□□□ -1.69

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