RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-209ENST00000532457 ILVBLA1L0T0 632 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-209ENST00000532457 STK10O94804 968 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-209ENST00000532457 TCF3P15923 654 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-209ENST00000532457 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-209ENST00000532457 PARP6Q2NL67 630 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-209ENST00000532457 MSS51Q4VC12 460 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-209ENST00000532457 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-209ENST00000532457 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-209ENST00000532457 HDXQ7Z353 690 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-209ENST00000532457 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-209ENST00000532457 MREGQ8N565 214 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-209ENST00000532457 DDI1Q8WTU0 396 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-209ENST00000532457 SMARCD2Q92925 531 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-209ENST00000532457 ASB2Q96Q27 587 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-209ENST00000532457 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-209ENST00000532457 SEMA4AQ9H3S1 761 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-209ENST00000532457 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-209ENST00000532457 SHOC2Q9UQ13 582 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-209ENST00000532457 CHADO15335 359 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC10A7Q0GE19 358 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 MTM1Q13496 603 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 SEMA5AQ13591 1074 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 C6orf118Q5T5N4 469 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 FYB2Q5VWT5 728 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 HOOK3Q86VS8 718 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 ASB16Q96NS5 453 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 FERMT1Q9BQL6 677 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 SPON2Q9BUD6 331 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 TRHDEQ9UKU6 1024 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 OR51B4Q9Y5P0 310 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 H0Y626 953 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 PRAMEF11O60813 436 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 BANF1O75531 89 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 APRTP07741 180 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 RHOCP08134 193 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 NFKB1P19838 968 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 HSD17B3P37058 310 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 GRIA1P42261 906 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 MPPE1Q53F39 396 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 RNF43Q68DV7 783 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 MTSS1LQ765P7 747 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF354CQ86Y25 554 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 FATE1Q969F0 183 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 E2F7Q96AV8 911 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 ALG14Q96F25 216 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 VAT1Q99536 393 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 PDFQ9HBH1 243 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 HPCAL4Q9UM19 191 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 WNT6Q9Y6F9 365 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 AVILO75366 819 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 HLA-DQB2P05538 268 aa22.38■■□□□ 1.17
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PACSIN3-209ENST00000532457 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 TRPV4Q9HBA0 871 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 KDELR3O43731 214 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 CACNG3O60359 315 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 FDFT1P37268 417 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 OLIG2Q13516 323 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 MPP7Q5T2T1 576 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 IL31Q6EBC2 164 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 PGBD5Q8N414 524 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 TEX26Q8N6G2 289 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 FEM1AQ9BSK4 669 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 GBA3Q9H227 469 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 SP110Q9HB58 689 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 ZFP14Q9HCL3 533 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 DOCK8Q8NF50 2099 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 PMS2P54278 862 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 SPARCL1Q14515 664 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 IHHQ14623 411 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF534Q76KX8 674 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 GLOD4Q9HC38 313 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 UBP1Q9NZI7 540 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 RSPH14Q9UHP6 348 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 ZMPSTE24O75844 475 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 CD160O95971 181 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-209ENST00000532457 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
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