RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531490.1

TRIM53CP-201, Transcript of tripartite motif containing 53C, pseudogene, humanhuman

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Gene TRIM53CP, Length 1,354 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM53CP-201ENST00000531490 EHD2Q9NZN4 543 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 KIAA1257Q9ULG3 409 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 CNTN6Q9UQ52 1028 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 SCML2Q9UQR0 700 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 URB1O60287 2271 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 H0Y626 953 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 GREM1O60565 184 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 TLR5O60602 858 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 ALDH1A2O94788 518 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 LRIG2O94898 1065 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 KAT7O95251 611 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 TRIM16O95361 564 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 MBD3O95983 291 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 SERPINF2P08697 491 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 PAEPP09466 180 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 RARGP13631 454 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 KRT5P13647 590 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 USP8P40818 1118 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 RGS7P49802 495 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 KLK7P49862 253 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 TKTL1P51854 596 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 ZNF132P52740 706 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 KRT31Q15323 416 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 DUOXA1Q1HG43 343 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 CDKAL1Q5VV42 579 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 PM20D1Q6GTS8 502 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 DENND1BQ6P3S1 775 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 RHBDF2Q6PJF5 856 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 BHLHA9Q7RTU4 235 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 WDTC1Q8N5D0 677 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 CLEC4CQ8WTT0 213 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 ZNF606Q8WXB4 792 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 OVCA2Q8WZ82 227 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 EXOC4Q96A65 974 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 ULBP1Q9BZM6 244 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 PNPLA8Q9NP80 782 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 ANO10Q9NW15 660 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 TAB2Q9NYJ8 693 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 CFAP97Q9P2B7 532 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 CYTH4Q9UIA0 394 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 DNAJC12Q9UKB3 198 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 EML5Q05BV3 1969 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 SPTA1P02549 2419 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 FAM170AA1A519 330 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 FAM149AA5PLN7 773 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 YJEFN3A6XGL0 299 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 E7ENQ6 273 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 PES1O00541 588 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 TRIM24O15164 1050 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 GJB3O75712 270 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 C1QL1O75973 258 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 NFATC1O95644 943 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 ZBED1O96006 694 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 KLKB1P03952 638 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 IRF1P10914 325 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 ATP1A3P13637 1013 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 LCP1P13796 627 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 TCF3P15923 654 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 RDXP35241 583 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 GPD2P43304 727 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 MFAP3P55082 362 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 ZNF33AQ06730 810 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 CYP4F3Q08477 520 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 BST2Q10589 180 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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TRIM53CP-201ENST00000531490 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa7.29□□□□□ -1.24
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TRIM53CP-201ENST00000531490 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 CCDC186Q7Z3E2 898 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 TMEM25Q86YD3 366 aa7.29□□□□□ -1.24
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TRIM53CP-201ENST00000531490 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 FAM114A1Q8IWE2 563 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 P2RY11Q96G91 374 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 PNKPQ96T60 521 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 SLC6A17Q9H1V8 727 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 IL21RQ9HBE5 538 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM53CP-201ENST00000531490 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
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