RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	PLAA	Q9Y263	795 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	ATP9B	O43861	1147 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	BNIP3L	O60238	219 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	PRAMEF10	O60809	474 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	PCDH8	O95206	1070 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	JMJD7	P0C870	316 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	LCP1	P13796	627 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	GCLM	P48507	274 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	VAMP7	P51809	220 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC12A1	Q13621	1099 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	DLG2	Q15700	870 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	CEP135	Q66GS9	1140 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	BORA	Q6PGQ7	559 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	DHX58	Q96C10	678 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	PADI4	Q9UM07	663 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276		D6RAR5	112 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	GCAT	O75600	419 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	NR3C1	P04150	777 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	CTSL	P07711	333 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	TRIM49	P0CI25	452 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	TRIM49C	P0CI26	452 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	ITIH1	P19827	911 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	PLK1	P53350	603 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	POLE2	P56282	527 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	PPP3CA	Q08209	521 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	FGL2	Q14314	439 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC39A14	Q15043	492 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	DTX1	Q86Y01	620 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	RBFA	Q8N0V3	343 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	TTC39C	Q8N584	583 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	UBA3	Q8TBC4	463 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	HESX1	Q9UBX0	185 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	AGRP	O00253	132 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	PIK3R2	O00459	728 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	RAD51B	O15315	384 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	SPINT1	O43278	529 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	GABBR2	O75899	941 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	KRT38	O76015	456 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	LTF	P02788	710 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	CCKBR	P32239	447 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	RABIF	P47224	123 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	CCL7	P80098	99 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	C1orf61	Q13536	156 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	CHSY1	Q86X52	802 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC39A13	Q96H72	371 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	SPAST	Q9UBP0	616 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276		A0A1W2PQ27	194 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276		A0A1W2PQ64	194 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276		A0A1W2PQC6	194 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276		A0A1W2PQM1	296 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	LMO7DN	F2Z398	122 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	RNF103	O00237	685 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	SPTLC2	O15270	562 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	ANXA6	P08133	673 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	TACR2	P21452	398 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	CHRNA3	P32297	505 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAM53C-208	ENST00000511276	NOS2	P35228	1153 aa		13.56	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms