RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KPNA6O60684 536 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WFS1O76024 890 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSHRP16473 764 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WASHC2DQ5SRD0 308 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM171A1Q5VUB5 890 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNX30Q5VWJ9 437 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNAJC9Q8WXX5 260 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CRISPLD1Q9H336 500 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BPGMP07738 259 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NFKB1P19838 968 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTPN3P26045 913 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCN5AQ14524 2016 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM86AQ8N2M4 240 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTC1Q99614 292 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCLRE1BQ9H816 532 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP4F11Q9HBI6 524 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNGB3Q9NQW8 809 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NMRK1Q9NWW6 199 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LOC100653049A0A140TA62 436 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGAP42A6NI28 874 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM159BA6NKW6 160 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBX10O75333 385 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GCATO75600 419 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT34O76011 436 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EML3Q32P44 896 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BTBD8Q5XKL5 378 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAS1R1Q7RTX1 841 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RASSF3Q86WH2 238 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF354CQ86Y25 554 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GIPC2Q8TF65 315 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RTP4Q96DX8 246 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MFSD3Q96ES6 412 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGAP2Q99490 1192 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAB39LQ9H9S4 337 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PNPLA8Q9NP80 782 aa15.81■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TADA2AO75478 443 aa15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZMPSTE24O75844 475 aa15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ETS2P15036 469 aa15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TYK2P29597 1187 aa15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD68P34810 354 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSPY1Q01534 308 aa15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCD5Q86SK9 330 aa15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NRG4Q8WWG1 115 aa15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PNPOQ9NVS9 261 aa15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSC2P49815 1807 aa15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NBNO60934 754 aa15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAGE1O75459 146 aa15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GJB3O75712 270 aa15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FUT4P22083 530 aa15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC25A3Q00325 362 aa15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OCRLQ01968 901 aa15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC36Q1X8D7 754 aa15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB41Q5JT25 222 aa15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAF7Q6Q0C0 670 aa15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C10orf107Q8IVU9 208 aa15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACBD6Q9BR61 282 aa15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WWP1Q9H0M0 922 aa15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VANGL2Q9ULK5 521 aa15.8■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SDR42E2A6NKP2 422 aa15.79■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NVLO15381 856 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PFDN1O60925 122 aa15.79■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF623O75123 536 aa15.79■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TGDSO95455 350 aa15.79■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPHB1P54762 984 aa15.79■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EFEMP1Q12805 493 aa15.79■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOGQ13253 232 aa15.79■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DLG2Q15700 870 aa15.79■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RASIP1Q5U651 963 aa15.79■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM171BQ6P995 826 aa15.79■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PACS1Q6VY07 963 aa15.79■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAN1C1Q9NR34 630 aa15.79■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF180Q9UJW8 692 aa15.79■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USP1O94782 785 aa15.79■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPL9P32969 192 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAXP61244 160 aa15.79■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa15.79■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TEX44Q53QW1 395 aa15.79■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LHX8Q68G74 356 aa15.79■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MCUQ8NE86 351 aa15.79■□□□□ 0.12
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACVR1CQ8NER5 493 aa15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.7 ms