RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 ALLCQ8N6M5 410 aa13.55□□□□□ -0.24
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HDLBP-241ENST00000487169 CAMKK2Q96RR4 588 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 BATF3Q9NR55 127 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 VPS51Q9UID3 782 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 ZMYM5Q9UJ78 669 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 COL1A2P08123 1366 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 BTNL10A8MVZ5 291 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 M0R3G1 203 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 EFCAB14O75071 495 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 RASSF9O75901 435 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 HPGDP15428 266 aa13.55□□□□□ -0.24
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HDLBP-241ENST00000487169 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 PLD3Q8IV08 490 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 RSPH1Q8WYR4 309 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 MPP6Q9NZW5 540 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 ITGAVP06756 1048 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 CCDC166P0CW27 439 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 XRCC4Q13426 336 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 CRY1Q16526 586 aa13.55□□□□□ -0.24
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HDLBP-241ENST00000487169 CCDC81Q6ZN84 652 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
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HDLBP-241ENST00000487169 ATP6V1B2P21281 511 aa13.55□□□□□ -0.24
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HDLBP-241ENST00000487169 TAF10Q12962 218 aa13.55□□□□□ -0.24
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HDLBP-241ENST00000487169 POM121L1PQ3SYA9 428 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa13.55□□□□□ -0.24
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HDLBP-241ENST00000487169 ZNF786Q8N393 782 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 C10orf53Q8N6V4 93 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 VTI1BQ9UEU0 232 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa13.55□□□□□ -0.24
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HDLBP-241ENST00000487169 ACSM2BQ68CK6 577 aa13.54□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 WDR48Q8TAF3 677 aa13.54□□□□□ -0.24
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HDLBP-241ENST00000487169 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa13.54□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 FBXO5Q9UKT4 447 aa13.54□□□□□ -0.24
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HDLBP-241ENST00000487169 PBX1P40424 430 aa13.54□□□□□ -0.24
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HDLBP-241ENST00000487169 IRF8Q02556 426 aa13.54□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 DEPDC1Q5TB30 811 aa13.54□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF662Q6ZS27 426 aa13.54□□□□□ -0.24
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HDLBP-241ENST00000487169 HGH1Q9BTY7 390 aa13.54□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 BBS2Q9BXC9 721 aa13.54□□□□□ -0.24
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HDLBP-241ENST00000487169 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa13.54□□□□□ -0.24
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HDLBP-241ENST00000487169 ARL2P36404 184 aa13.54□□□□□ -0.24
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HDLBP-241ENST00000487169 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa13.54□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 AUHQ13825 339 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
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