RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ARTNQ5T4W7 220 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 BTBD8Q5XKL5 378 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 SYCE2Q6PIF2 218 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PAQR9Q6ZVX9 377 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 LEMD2Q8NC56 503 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 APPL2Q8NEU8 664 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 VPS37AQ8NEZ2 397 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ZFP28Q8NHY6 868 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 DENND1AQ8TEH3 1009 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PPP4R1Q8TF05 950 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 GDPD5Q8WTR4 605 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 SGCDQ92629 289 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 KIF12Q96FN5 646 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 TSG101Q99816 390 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 CTRCQ99895 268 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PLK2Q9NYY3 685 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 TRMUO75648 421 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 APOEP02649 317 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ATF2P15336 505 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 VCLP18206 1134 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 MXI1P50539 228 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 BCAP31P51572 246 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ARID5AQ03989 594 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ARCQ7LC44 396 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 GPR149Q86SP6 731 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 GLRX5Q86SX6 157 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ZBTB33Q86T24 672 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 RASSF3Q86WH2 238 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 C18orf8Q96DM3 657 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 KLHL3Q9UH77 587 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 DOCK8Q8NF50 2099 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 TMEM114B3SHH9 223 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 GOLGA8TH3BQL2 631 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 DNAJC6O75061 913 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 HAUS5O94927 633 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PGM3O95394 542 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 POMCP01189 267 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PTPN5P54829 565 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 KRT17Q04695 432 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PDK3Q15120 406 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 NADK2Q4G0N4 442 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 BHLHA9Q7RTU4 235 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 DEFB123Q8N688 67 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PMM1Q92871 262 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 VMP1Q96GC9 406 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 MTMR12Q9C0I1 747 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 FANCEQ9HB96 536 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 GTF3C4Q9UKN8 822 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 MTUS1Q9ULD2 1270 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PCDHGC3Q9UN70 934 aa7.84□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ZBBXA8MT70 800 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 HIDE1A8MVS5 230 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 MOSPD3O75425 235 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 ACSL3O95573 720 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 CLPTM1O96005 669 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 CNPP09543 421 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 SERPINB6P35237 376 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 ACTR3P61158 418 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 SPARCL1Q14515 664 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 KCNJ8Q15842 424 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 RAPH1Q70E73 1250 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 LRRC6Q86X45 466 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 OR10T2Q8NGX3 314 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 ZNF461Q8TAF7 563 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 ACMSDQ8TDX5 336 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 GIPC3Q8TF64 312 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 SFXN1Q9H9B4 322 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 OBP2AQ9NY56 170 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 HMGXB4Q9UGU5 601 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 DPP7Q9UHL4 492 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 USTQ9Y2C2 406 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 USP3Q9Y6I4 520 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 CDH16O75309 829 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 FGF19O95750 216 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 TTC4O95801 387 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 CTNNA2P26232 953 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 PGM1P36871 562 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 SCNN1AP37088 669 aa7.83□□□□□ -1.16
USP4-211ENST00000485450 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
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