RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 GALNT7Q86SF2 657 aa3.56□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 TRIM74Q86UV6 250 aa3.56□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 TRIM73Q86UV7 250 aa3.56□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 MON1AQ86VX9 555 aa3.56□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 SCAIQ8N9R8 606 aa3.56□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 USP38Q8NB14 1042 aa3.56□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 ZUFSPQ96AP4 578 aa3.56□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 MPHOSPH8Q99549 860 aa3.56□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 SLC32A1Q9H598 525 aa3.56□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 UTS2RQ9UKP6 389 aa3.56□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 PNMA2Q9UL42 364 aa3.56□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 PER2O15055 1255 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 ANP32CO43423 234 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 RNF8O76064 485 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 SGPL1O95470 568 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 METTL18O95568 372 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 TBX18O95935 607 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 TUBB4AP04350 444 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 FCGR2AP12318 317 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 GSTM2P28161 218 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 RPS6KA3P51812 740 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 EFNA5P52803 228 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 ZNF91Q05481 1191 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 LAMB3Q13751 1172 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 PKP1Q13835 747 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 NFIL3Q16649 462 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 Q4G0T1 1027 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 TTLL5Q6EMB2 1281 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 GJB7Q6PEY0 223 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 SLC22A25Q6T423 547 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 CNGA4Q8IV77 575 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 UEVLDQ8IX04 471 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 PAF1Q8N7H5 531 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 PLD5Q8N7P1 536 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 NAXEQ8NCW5 288 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 RNF125Q96EQ8 232 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 MPP4Q96JB8 637 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 MARK4Q96L34 752 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 EYA3Q99504 573 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 SEMA4CQ9C0C4 833 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 MAF1Q9H063 256 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 TAOK3Q9H2K8 898 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 ICKQ9UPZ9 632 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.55□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 A6NNC1 897 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 LDLRAD4O15165 306 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 MSI1O43347 362 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 TSPAN3O60637 253 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 NFATC1O95644 943 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 DDAH2O95865 285 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 ALPLP05186 524 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 URODP06132 367 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 TFEBP19484 476 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 CERS1P27544 350 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 PGM1P36871 562 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 NAA25Q14CX7 972 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 ODF3L2Q3SX64 289 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 C10orf76Q5T2E6 689 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 TMEM63BQ5T3F8 832 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 RINLQ6ZS11 566 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 GPSM1Q86YR5 675 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 KLBQ86Z14 1044 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 ADGRF4Q8IZF3 695 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 KCNG4Q8TDN1 519 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 SIGLEC11Q96RL6 698 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 FUZQ9BT04 418 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 HEMGNQ9BXL5 484 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 SLC26A6Q9BXS9 759 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 SLC25A18Q9H1K4 315 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 SPAG4Q9NPE6 437 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 CNPY2Q9Y2B0 182 aa3.54□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa3.53□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 MYMKA6NI61 221 aa3.53□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 E5RJQ4 531 aa3.53□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 RHODO00212 210 aa3.53□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 SPTLC2O15270 562 aa3.53□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 MBD4O95243 580 aa3.53□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 CBX6O95503 412 aa3.53□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 ADAP00813 363 aa3.53□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 CTSAP10619 480 aa3.53□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 PRKCHP24723 683 aa3.53□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 KLRC2P26717 231 aa3.53□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 GJC1P36383 396 aa3.53□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 RGS2P41220 211 aa3.53□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 CPA2P48052 419 aa3.53□□□□□ -1.84
SENP6-208ENST00000483859 VAMP2P63027 116 aa3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms