RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 MAATS1Q7Z4T9 603 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 ADIPOR2Q86V24 386 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
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NISCH-208ENST00000481211 CCDC105Q8IYK2 499 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 APCDD1Q8J025 514 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 ATG4AQ8WYN0 398 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 CHFRQ96EP1 664 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 LGMNQ99538 433 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 HEBP1Q9NRV9 189 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 ELOVL2Q9NXB9 296 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa13.3□□□□□ -0.28
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NISCH-208ENST00000481211 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 XIRP2A4UGR9 3374 aa13.29□□□□□ -0.28
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NISCH-208ENST00000481211 C5orf60A6NFR6 353 aa13.29□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 NARSO43776 548 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 OPHN1O60890 802 aa13.29□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 NEBLO76041 1014 aa13.29□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 ECEL1O95672 775 aa13.29□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 CCNB1P14635 433 aa13.29□□□□□ -0.28
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NISCH-208ENST00000481211 SLC6A11P48066 632 aa13.29□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
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NISCH-208ENST00000481211 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
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NISCH-208ENST00000481211 SNX1Q13596 522 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 ZNF235Q14590 738 aa13.28□□□□□ -0.28
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NISCH-208ENST00000481211 ALG1LQ6GMV1 187 aa13.28□□□□□ -0.28
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NISCH-208ENST00000481211 TP53INP2Q8IXH6 220 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 SYNPOQ8N3V7 929 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 TTC8Q8TAM2 541 aa13.28□□□□□ -0.28
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NISCH-208ENST00000481211 CCDC114Q96M63 670 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 SPATA13Q96N96 652 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 PSKH2Q96QS6 385 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 TMEM121Q9BTD3 319 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 CIPCQ9C0C6 399 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-208ENST00000481211 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
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NISCH-208ENST00000481211 ATP9BO43861 1147 aa13.27□□□□□ -0.29
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NISCH-208ENST00000481211 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP13.27□□□□□ -0.29
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NISCH-208ENST00000481211 SOX9P48436 509 aa13.27□□□□□ -0.29
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NISCH-208ENST00000481211 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
NISCH-208ENST00000481211 DR1Q01658 176 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-208ENST00000481211 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP13.27□□□□□ -0.29
NISCH-208ENST00000481211 WASHC5Q12768 1159 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-208ENST00000481211 SLC14A2Q15849 920 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-208ENST00000481211 DGKKQ5KSL6 1271 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-208ENST00000481211 TMEM215Q68D42 235 aa13.27□□□□□ -0.29
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