RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 GLTPQ9NZD2 209 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 PLA2G4CQ9UP65 541 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 GDAQ9Y2T3 454 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 RAD54BQ9Y620 910 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 PSME4Q14997 1843 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 CLUHO75153 1309 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 ABCB11O95342 1321 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A1W2PPW3 197 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 PSMD9O00233 223 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 KCNQ3O43525 872 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 SORBS3O60504 671 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 PRMT3O60678 531 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 USP12O75317 370 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 TAF5LO75529 589 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 ARIH2O95376 493 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 CYP17A1P05093 508 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 NR3C2P08235 984 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 PRKAR1AP10644 381 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 SELLP14151 372 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 RAC2P15153 192 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 MAPK1P28482 360 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 L1CAMP32004 1257 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 LIMK1P53667 647 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 MAPK12P53778 367 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 DPYDQ12882 1025 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 NFATC3Q12968 1075 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 GALEQ14376 348 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 RUNDC3AQ59EK9 446 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 AADACL4Q5VUY2 407 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 KSR2Q6VAB6 950 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 OTOAQ7RTW8 1153 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 CATSPER3Q86XQ3 398 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 CPA6Q8N4T0 437 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 PXYLP1Q8TE99 480 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 PDXPQ96GD0 296 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 HES6Q96HZ4 224 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.334e-8■■■■■ 42.2
RABGGTB-208ENST00000471759 SERPINI1Q99574 410 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 C12orf57Q99622 126 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 IDI2Q9BXS1 227 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC2A11Q9BYW1 496 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 TRIM31Q9BZY9 425 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 MCCC2Q9HCC0 563 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 IFT46Q9NQC8 304 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 ENPP5Q9UJA9 477 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 DTX4Q9Y2E6 619 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
RABGGTB-208ENST00000471759 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 COL4A5P29400 1685 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 NRCAMQ92823 1304 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 DBX1A6NMT0 343 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF487B1APH4 448 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 B4E1Z4 1266 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 H3BMM5 538 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 TBX3O15119 743 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 CFBP00751 764 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 IL6P05231 212 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 CYP3A4P08684 503 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 SRCP12931 536 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 CTNNA2P26232 953 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 IL12AP29459 219 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 MAGEA4P43358 317 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 SERPINB10P48595 397 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 GPLD1P80108 840 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 STAT4Q14765 748 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 ECM1Q16610 540 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms