RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	RASA4B	C9J798	803 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	MCF2L	O15068	1137 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	DCLK1	O15075	740 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	RASA4	O43374	803 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	SIN3B	O75182	1162 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ADH1B	P00325	375 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ACVRL1	P37023	503 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ARSE	P51690	589 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	VAV2	P52735	878 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	CDH6	P55285	790 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ARF5	P84085	180 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	KRT81	Q14533	505 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PLK5	Q496M5	336 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PMS2CL	Q68D20	193 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	KBTBD6	Q86V97	674 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF366	Q8N895	744 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PHOX2B	Q99453	314 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	KLC2	Q9H0B6	622 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ARHGAP6	O43182	974 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PSTPIP1	O43586	416 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	NRDC	O43847	1150 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	MT-CO1	P00395	513 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	DNTT	P04053	509 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	RET	P07949	1114 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	C5AR1	P21730	350 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TPMT	P51580	245 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ACCSL	Q4AC99	568 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	KCTD6	Q8NC69	237 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TMIE	Q8NEW7	156 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	RUBCN	Q92622	972 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	FAF2	Q96CS3	445 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	FAM129B	Q96TA1	746 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	FZD4	Q9ULV1	537 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	MAP3K13	O43283	966 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	GFRA3	O60609	400 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	CD160	O95971	181 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PRNP	P04156	253 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	GLDC	P23378	1020 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	CD6	P30203	668 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	HOXD12	P35452	270 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	MRE11	P49959	708 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TAS2R40	P59535	323 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	DPYSL3	Q14195	570 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	CST6	Q15828	149 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	KIAA1328	Q86T90	577 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	STK40	Q8N2I9	435 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	HMCES	Q96FZ2	354 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	SGK2	Q9HBY8	427 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	SLC7A4	O43246	635 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	SPOP	O43791	374 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PRAMEF11	O60813	436 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFS2	O75306	463 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	EPN2	O95208	641 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PTPA-222	ENST00000445241	GSR	P00390	522 aa		14.91	□□□□□ -0.02

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