RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
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TOP3B-206ENST00000436282 H3BNH8 94 aa15.18■□□□□ 0.02
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TOP3B-206ENST00000436282 TFEBP19484 476 aa15.18■□□□□ 0.02
TOP3B-206ENST00000436282 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.02
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TOP3B-206ENST00000436282 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa15.18■□□□□ 0.02
TOP3B-206ENST00000436282 BBS5Q8N3I7 341 aa15.18■□□□□ 0.02
TOP3B-206ENST00000436282 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.02
TOP3B-206ENST00000436282 RDH11Q8TC12 318 aa15.18■□□□□ 0.02
TOP3B-206ENST00000436282 ATP6V1E2Q96A05 226 aa15.18■□□□□ 0.02
TOP3B-206ENST00000436282 TMIGD2Q96BF3 282 aa15.18■□□□□ 0.02
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TOP3B-206ENST00000436282 CXCL16Q9H2A7 254 aa15.18■□□□□ 0.02
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TOP3B-206ENST00000436282 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa15.17■□□□□ 0.02
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TOP3B-206ENST00000436282 GJA5P36382 358 aa15.17■□□□□ 0.02
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TOP3B-206ENST00000436282 PRKAA2P54646 552 aa15.17■□□□□ 0.02
TOP3B-206ENST00000436282 TUBA4AP68366 448 aa15.17■□□□□ 0.02
TOP3B-206ENST00000436282 IKBKEQ14164 716 aa15.17■□□□□ 0.02
TOP3B-206ENST00000436282 PTK2BQ14289 1009 aa15.17■□□□□ 0.02
TOP3B-206ENST00000436282 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TOP3B-206ENST00000436282 NXNQ6DKJ4 435 aa15.17■□□□□ 0.02
TOP3B-206ENST00000436282 HSPBAP1Q96EW2 488 aa15.17■□□□□ 0.02
TOP3B-206ENST00000436282 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TOP3B-206ENST00000436282 B3GNT5Q9BYG0 378 aa15.17■□□□□ 0.02
TOP3B-206ENST00000436282 ASB7Q9H672 318 aa15.17■□□□□ 0.02
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